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Enregistrement W4402758883 · doi:10.1101/2024.09.20.24313635

Characterizing trachoma elimination using serology

2024· preprint· en· W4402758883 sur OpenAlexaff
Everlyn Kamau, Pearl Anne Ante-Testard, Sarah Gwyn, Seth Blumberg, Zeinab Abdalla, Kristen Aiemjoy, Abdou Amza, Solomon Aragie, Ahmed M. Arzika, Marcel S Awoussi, Robin L. Bailey, Robert Butcher, E. Kelly Callahan, David Chaima, Adisu Abebe Dawed, Abou-Bakr Sidik Domingo, Chris Drakeley, Belgesa E Elshafie, Paul M. Emerson, Kimberly Fornace, Katherine Gass, E. Brook Goodhew, Jaouad Hammou, Emma M. Harding‐Esch, PJ Hooper, Boubacar Kadri, Khumbo Kalua, Sarjo Kanyi, Mabula Kasubi, Amir Bedri Kello, Robert Ko, Patrick J. Lammie, Andrés G. Lescano, Ramatou Maliki, Michael Masika, Stephanie J Migchelsen, Beido Nassirou, John M. Nesemann, Nishanth Parameswaran, Willie Pomat, Kristen K. Renneker, Chrissy h. Roberts, Prudence Rymil, Eshetu Sata, Laura Senyonjo, Fikre Seife, Ansumana Sillah, Oliver Sokana, Ariktha Srivathsan, Zerihun Tadesse, Fasihah Taleo, Emma Michelle Taylor, Rababe Tekeraoi, Kwamy Togbey, Sheila K. West, Karana Wickens, Timothy William, Dionna M. Wittberg, Dorothy Yeboah‐Manu, Mohammed Youbi, Tàye Zeru, Jeremy D. Keenan, Thomas M. Lietman, Anthony W. Solomon, Scott D. Nash, Diana L. Martin, Benjamin F. Arnold

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésTrachomaSerologyMedicineImmunologyAntibodyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Trachoma is targeted for global elimination as a public health problem by 2030. Measurement of IgG antibodies in children is being considered for surveillance and programmatic decision-making. There are currently no guidelines for applications of serology, which represents a generalizable problem in seroepidemiology and disease elimination. We collated Chlamydia trachomatis Pgp3 and CT694 IgG measurements (63,911 children ages 1–9 years) from 48 serosurveys, including surveys across Africa, Latin America, and the Pacific Islands to estimate population-level seroconversion rates (SCR) along a gradient of trachoma endemicity. We propose a novel, generalizable approach to estimate the probability that population C. trachomatis transmission is below levels requiring ongoing programmatic action, or conversely is above levels that indicate ongoing interventions are needed. We provide possible thresholds for SCR at a specified level of certainty and illustrate how the approach could be used to inform trachoma program decision-making using serology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,372
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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