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Enregistrement W4402759641 · doi:10.3390/diagnostics14192116

Assessing Biofilm at the Bedside: Exploring Reliable Accessible Biofilm Detection Methods

2024· article· en· W4402759641 sur OpenAlexafffund
Perry Mayer, Allie Clinton Smith, Jennifer Hurlow, Brian R Morrow, Gregory Bohn, Philip G. Bowler

Notice bibliographique

RevueDiagnostics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueWound Healing and Treatments
Établissements canadiensThe Mayer Institute
Organismes subventionnairesFaculty of Dentistry, University of TorontoHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoTexas Tech University
Mots-clésBiofilmBlotGold standard (test)MicrobiologyBiomedical engineeringBacteriaChemistryBiologyMedicineRadiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Biofilm is linked through a variety of mechanisms to the pathogenesis of chronic wounds. However, accurate biofilm detection is challenging, demanding highly specialized and technically complex methods rendering it unapplicable for most clinical settings. This study evaluated promising methods of bedside biofilm localization, fluorescence imaging of wound bacterial loads, and biofilm blotting by comparing their performance against validation scanning electron microscopy (SEM). METHODS: In this clinical trial, 40 chronic hard-to-heal wounds underwent the following assessments: (1) clinical signs of biofilm (CSB), (2) biofilm blotting, (3) fluorescence imaging for localizing bacterial loads, wound scraping taken for (4) SEM to confirm matrix encased bacteria (biofilm), and (5) PCR (Polymerase Chain Reaction) and NGS (Next Generation Sequencing) to determine absolute bacterial load and species present. We used a combination of SEM and PCR microbiology to calculate the diagnostic accuracy measures of the CSB, biofilm blotting assay, and fluorescence imaging. RESULTS: Study data demonstrate that 62.5% of wounds were identified as biofilm-positive based on SEM and microbiological assessment. By employing this method to determine the gold truth, and thus calculate accuracy measures for all methods, fluorescence imaging demonstrated superior sensitivity (84%) and accuracy (63%) compared to CSB (sensitivity 44% and accuracy 43%) and biofilm blotting (sensitivity 24% and accuracy 40%). Biofilm blotting exhibited the highest specificity (64%), albeit with lower sensitivity and accuracy. Using SEM alone as the validation method slightly altered the results, but all trends held constant. DISCUSSION: This trial provides the first comparative assessment of bedside methods for wound biofilm detection. We report the diagnostic accuracy measures of these more feasibly implementable methods versus laboratory-based SEM. Fluorescence imaging showed the greatest number of true positives (highest sensitivity), which is clinically relevant and provides assurance that no pathogenic bacteria will be missed. It effectively alerted regions of biofilm at the point-of-care with greater accuracy than standard clinical assessment (CSB) or biofilm blotting paper, providing actionable information that will likely translate into enhanced therapeutic approaches and better patient outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,849
Score d'incertitude au seuil0,462

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,153
Tête enseignante GPT0,438
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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