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Enregistrement W4402765810 · doi:10.1101/2024.09.23.614496

Identification of neurodevelopmental organization of the cell populations of juvenile Huntington’s disease using dorso-ventral HD organoids and HD mouse embryos

2024· preprint· en· W4402765810 sur OpenAlexaff
Karolina Świtońska-Kurkowska, Jakub Kubiś, Joanna Delimata-Raczek, Bart Krist, Magda Surdyka, Żaneta Kalinowska-Pośka, Piotr Piasecki, Luiza Handschuh, Jan Podkowiński, Magdalena Rakoczy, Anna Samelak-Czajka, Michael R. Hayden, Nicholas S. Caron, Maciej Figiel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOrganoidJuvenileBiologyIdentification (biology)EmbryoDiseaseNeuroscienceCell biologyGeneticsPathologyMedicineEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Huntington’s disease (HD), especially juvenile-onset HD (JOHD), involves early neurodevelopmental pathogenesis alongside the gradual breakdown of the corticostriatal neural axis. To better understand this mechanism, we created fused dorsal–ventral forebrain organoids from induced pluripotent stem cells (iPSCs) from JOHD to mimic early corticostriatal interactions in the disease. We observed characteristic growth phenotypes in HD organoids and found that these phenotypes were influenced by paracrine signals from opposite regions (dorsal-ventral and ventral-dorsal). These phenotypes were only partially rescued by conditioning with medium in HD compared to control organoids. We also investigated humanized HD embryonic mouse forebrains at E13.5 to validate the phenotypes. Using single-cell RNA sequencing (scRNAseq) and immunofluorescence of the internal structure of HD organoids, we observed early neurodevelopmental signs, including stalling during the phase of increased progenitor cell growth, delayed neuron maturation, and disrupted patterning between pallial and subpallial regions. A consistent feature across in vitro and in vivo models was an abnormal expansion of transthyretin (TTR)-positive cells resembling choroid plexus (ChP), along with ectopic expression of neuronal factors in ChP and a reduction in populations expressing intermediate progenitor and interneuron markers. In mosaic organoids that combined healthy and JOHD tissues, the healthy environment helped reduce ChP overgrowth and restore normal progenitor and neuronal development. This suggests that some developmental defects caused by mutant HTT are reversible and influenced by non-cell-autonomous factors. Overall, these findings point to early ChP-related abnormalities as a key aspect of JOHD neurodevelopmental disturbance and propose the ChP–CSF environment as an important area for future mechanistic studies and potential therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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