Practical media formulations for rapid growth of <i>Lactobacillus iners</i> and other vaginal bacteria
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Vaginal microbiome composition is closely tied to host health. A microbiome dominated by specific anaerobes (e.g., Gardnerella vaginalis ) is termed bacterial vaginosis (BV) and is associated with negative health outcomes, while colonization by Lactobacillus species is thought to protect against BV. However, the role of the species Lactobacillus iners in vaginal health is controversial, with evidence that some strains may not protect against BV while others do. To better characterize L. iners strains, their interactions with vaginal bacteria and human cells need to be investigated in vitro , but this has been impeded by the lack of liquid media for rapid L. iners growth. We have developed three liquid media formulations for L. iners growth: Serrador’s Lactobacilli-adapted Iscove’s Medium (SLIM) which leads to robust L. iners growth, a vaginally adapted version of SLIM (SLIM-V) and a chemically defined medium (SLIM-CD). SLIM and SLIM-V lead to dramatically improved L. iners growth compared to previously published formulations and support growth of other vaginal bacteria, including L. crispatus, L. jensenii, L. gasseri and G. vaginalis . SLIM-CD leads to slower growth but could prove useful for characterizing L. iners nutrient requirements or metabolite production. A modified version of SLIM-V supports growth of human cervical epithelial cells and provides a base for future co-culture work. Here, we present the formulations of SLIM, SLIM-V and SLIM-CD, and compare the growth of bacterial strains and human cells in the media.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».