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Enregistrement W4402852912 · doi:10.1101/2024.09.24.614639

Pdgfab/Pdgfra-mediated chemoattraction guides the migration of sclerotome-derived fibroblast precursors in zebrafish

2024· preprint· en· W4402852912 sur OpenAlexaff
Emilio E. Méndez‐Olivos, Katrinka M. Kocha, Shan Liao, Peng Huang

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebrafishPDGFRABiologyAnatomyCell biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT In vertebrates, the sclerotome is a transient embryonic structure that gives rise to various tissue support cells, including fibroblasts. However, how fibroblast precursors are guided to diverse tissues remain poorly understood. Using zebrafish, our lab has previously shown that sclerotome-derived cells undergo extensive migration to generate distinct fibroblasts subtypes, including tenocytes along the myotendinous junction and fin mesenchymal cells in the fin fold. Interestingly, the pan-fibroblast gene platelet-derived growth factor receptor a ( pdgfra ), which has been implicated in cell migration across various contexts, is specifically expressed in the sclerotome and its descendants. Loss of functional Pdgfra in a pdgfra gene-trap mutant results in severe defects in the migration of sclerotome- derived cells, leading to a dose-dependent loss of tenocytes and fin mesenchymal cells. By combining live imaging and mosaic labeling with a membrane-bound dominant-negative tool, we demonstrate that Pdgfra acts cell-autonomously to regulate the migration of sclerotome- derived cells. In the absence of ligand pdgfab , which is expressed in the medial somite, sclerotome-derived cells fail to migrate medially, resulting in a loss of tenocytes, although they can migrate normally toward the fin fold and generate fin mesenchymal cells. Strikingly, localized expression of Pdgfab in pdgfab mutants can direct the migration of sclerotome- derived cells to both normal and ectopic locations, suggesting a chemoattractive role for the Pdgfab ligand. Together, our results demonstrate that Pdgfab/Pdgfra-mediated chemoattraction guides the migration of sclerotome-derived fibroblast precursors to specific locations, where they diversify into distinct fibroblast subtypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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