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Enregistrement W4402877612 · doi:10.1017/s0033291724001880

Genome-wide meta-analysis of ascertainment and symptom structures of major depression in case-enriched and community cohorts

2024· review· en· W4402877612 sur OpenAlexaff
Mark J. Adams, Jackson G. Thorp, Bradley Jermy, Alex S. F. Kwong, Kadri Kõiv, Andrew D. Grotzinger, Michel G. Nivard, Sally Marshall, Yuri Milaneschi, Bernhard T. Baune, Bertram Müller‐Myhsok, Brenda W.J.H. Penninx, Dorret I. Boomsma, Douglas F. Levinson, Gerome Breen, Giorgio Pistis, Hans J. Grabe, Henning Tiemeier, Klaus Berger, Marcella Rietschel, Patrik K. E. Magnusson, Rudolf Uher, Steven P. Hamilton, Susanne Lucae, Kelli Lehto, Qingqin S. Li, Enda M. Byrne, Ian B. Hickie, Nicholas G. Martin, Sarah E. Medland, Naomi R. Wray, Elliot M. Tucker–Drob, Cathryn M. Lewis, Andrew M. McIntosh, Eske M. Derks

Notice bibliographique

RevuePsychological Medicine · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNational Health and Medical Research CouncilEuropean Research CouncilLeids Universitair Medisch CentrumMedical Research CouncilNational Institute for Health Research Collaboration for Leadership in Applied Health Research and Care North West CoastEuropean CommissionGGZ DrentheRivierduinenUniversitair Medisch Centrum GroningenNational Institutes of HealthGGZ inGeestEesti TeadusagentuurUniversiteit LeidenEuropean Regional Development FundGGZ FrieslandKing's College LondonRijksuniversiteit GroningenNIHR Maudsley Biomedical Research CentreUniversity of BristolNational Institute for Health and Care ResearchWellcome TrustNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekVrije Universiteit Amsterdam
Mots-clésBiobankAnhedoniaDepression (economics)Major depressive disorderMedicineClinical psychologyPsychiatryPsychologySchizophrenia (object-oriented programming)BioinformaticsMoodBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Diagnostic criteria for major depressive disorder allow for heterogeneous symptom profiles but genetic analysis of major depressive symptoms has the potential to identify clinical and etiological subtypes. There are several challenges to integrating symptom data from genetically informative cohorts, such as sample size differences between clinical and community cohorts and various patterns of missing data. METHODS: We conducted genome-wide association studies of major depressive symptoms in three cohorts that were enriched for participants with a diagnosis of depression (Psychiatric Genomics Consortium, Australian Genetics of Depression Study, Generation Scotland) and three community cohorts who were not recruited on the basis of diagnosis (Avon Longitudinal Study of Parents and Children, Estonian Biobank, and UK Biobank). We fit a series of confirmatory factor models with factors that accounted for how symptom data was sampled and then compared alternative models with different symptom factors. RESULTS: symptoms and an additional measurement factor that accounted for the skip-structure in community cohorts (use of Depression and Anhedonia as gating symptoms). CONCLUSION: The results show the importance of assessing the directionality of symptoms (such as hypersomnia versus insomnia) and of accounting for study and measurement design when meta-analyzing genetic association data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,407
Score d'incertitude au seuil0,627

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,423
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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