Effect of Different Feeding Habits on Metabolomics Profiles and Microbiota Composition and Functions of Tilapia Gut
Notice bibliographique
Résumé
As an omnivorous fish, wild tilapia feed on both animal and plant foods, depending on what is available. To understand the nutritional function of the gut microbiota of tilapia, we used shotgun metagenomic sequencing, untargeted metabolomics analysis, and 16S rRNA gene sequencing to study the metabolites and gut microbial communities in tilapia eating different diets (artemia nauplii in the carnivorous diet; plant‐based pelleted feed [PBP] in the herbivorous diet; and a mixture of these two in the omnivorous diet). A total of 225 Nile tilapia ( Oreochromis niloticus ) were cultured in nine 1500 L outdoor tanks, with three replicate tanks per diet and 25 fish per tank. β ‐diversity analysis revealed that there was no significant difference in microbial structure between the three diets. However, significant differences were detected in gut metabolites. The abundance of the core bacteria in tilapia intestine (genus Cetobacterium ) increased significantly when an omnivorous diet was fed. Cetobacterium abundance was significantly correlated to some differential metabolites including glucose and amino acids, and significantly correlated to pathways of carbohydrate and amino acids metabolism, identified by metagenome analysis. Metagenomic binning produced seven Cetobacterium MAGs with the completeness >50% and contamination <10%, in which genes related to the above metabolites and metabolism pathways were identified. All seven MAGs contained CAZymes that could act on distinct carbohydrates, providing highly diversified capabilities to this genus to cope with both animal and plant glycans. These tilapia fed with an omnivorous diet also showed increased growth. The differential intestinal metabolites aspartate, isoleucine, ornithine, proline, nicotinate, and NAD+ could be related to the increased growth. Our results expanded the understanding of how tilapia have adapted to an omnivorous diet and may provide knowledge for improving aquaculture management.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».