Assessment of Real-Time PCR Techniques for the Detection of Airborne Fungal Pathogens of Wheat: Role of DNA Extraction on Spore Quantification
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Our research focused on developing a highly sensitive whole-spore real-time immuno-PCR (RT-iPCR) assay for the detection of three wheat fungal pathogens: Pyrenophora tritici-repentis ( Ptr ), Fusarium graminearum ( Fg ), and Puccinia striiformis forma specialis (f. sp.) tritici ( Pst ). RT-iPCR measurements were compared to more well-established quantitative PCR (qPCR) assays to compare their performance. While specificity remained a challenge for RT-iPCR, the direct spore measurements negate the need for DNA extraction, making RT-iPCR a potentially valuable technique that warrants further research. An alternative approach was developed to determine DNA extraction efficiency and quantification of spore numbers by qPCR, which is currently a methodological gap in most qPCR spore measurements. DNA extraction efficiency determined for Fg, Pst, and Ptr spores were 5.0 ± 0.1, 7.0 ± 0.4, and 290 ± 36%, respectively, demonstrating important implications for the accuracy of these techniques when DNA recovery is not considered.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle