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Enregistrement W4402930943 · doi:10.1101/2024.09.25.615065

Crosstalk between the aryl hydrocarbon receptor and hypoxia inducible factor 1α pathways impairs downstream dioxin response in human islet models

2024· preprint· en· W4402930943 sur OpenAlexafffund
Noa Gang, Kyle A. van Allen, William G. Willmore, Francis C. Lynn, Jennifer E. Bruin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCarleton UniversityBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of AlbertaCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of OntarioBC Children's Hospital
Mots-clésAryl hydrocarbon receptorCrosstalkIsletDownstream (manufacturing)Hypoxia-inducible factorsHypoxia (environmental)Cell biologyChemistryReceptorArylBiologyEndocrinologyTranscription factorBiochemistryDiabetes mellitusGeneEngineeringOxygenElectronic engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The incidence of type 2 diabetes (T2D) is increasing globally at a rate that cannot be explained solely by genetic predisposition, diet, or lifestyle. Epidemiology studies report positive associations between exposure to persistent organic pollutants, such as dioxins, and T2D. We previously showed that 2,3,7,8 tetrachlorodibenzo- p -dioxin (TCDD) activates the xenobiotic-sensitive aryl hydrocarbon receptor (AHR) in pancreatic islets. The AHR is known to crosstalk with the hypoxia inducible factor 1α (HIF1α) in hepatocytes but whether this crosstalk occurs in islet cells remains unknown. We assessed AHR-HIF1α pathway crosstalk by treating human donor islets and stem cell-derived islets (SC-islets) with TCDD +/- hypoxia and examined the changes in downstream targets of both AHR (e.g., CYP1A1 ) and HIF1α (e.g., HMOX1 ). SC-islets showed consistent crosstalk between AHR and HIF1α pathways; co-treatment of SC-islets with TCDD + hypoxia robustly suppressed the magnitude of CYP1A1 induction compared with TCDD treatment alone. In human islets, only 2 of 6 donors showing suppressed CYP1A1 induction following TCDD + hypoxia co-treatment. In both SC-islets and human donor islets we observed an unexpected hypoxia-mediated suppression of glucose-6-phosphate catalytic subunit 2 ( G6PC2 ) expression. Our study shows AHR-HIF1α crosstalk occurs in both SC-islets and primary human donor islets, but the response of human islets varied between donors. In both models, the HIF1α pathway dominated over the AHR pathway during TCDD + hypoxia co-treatment. Our study is the first to examine whether AHR-HIF1α crosstalk occurs in islet cells and presents novel data on the impact of hypoxia on G6PC2 gene expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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