Species subdivision of ramie (Boehmeria nivea; Urticaceae), a species with wild, domesticated and feral forms, based on integrative taxonomy
Notice bibliographique
Résumé
Feralization, the re-establishment of wild populations from domesticated ancestors, can involve multiple parallel character reversions, and potentially also rampant gene flow with cultivated and/or naturally wild material. It hence poses great challenges for infraspecific classification, which may impede crop development, but studies on these issues are rare. Ramie (Boehmeria nivea; Urticaceae) is an important fiber crop worldwide. It has been traditionally divided into 2-4 varieties, but these are controversial. Here, 78 wild and feral individuals were sampled from 12 Chinese provinces, plus 11 cultivated individuals from farmland. We employed an integrative taxonomy approach combining multiple lines of evidence from morphology, phylogenomics, and ecology to investigate the intraspecific subdivision of B. nivea. A chi-square test of qualitative morphological traits significantly distinguished three varieties within B. nivea: var. nivea, var. tenacissima and the recently described, var. strigosa, comprising respectively mainly cultivated, mainly feralized, and only naturally wild material. The morphological PCoA and random forest analyses both indicated differences between var. strigosa and the other two varieties. However, quantitative traits cannot distinguish the three varieties. No variety was monophyletic according to phylogenetic analysis of plastome data, whereas var. strigosa was weakly supported as monophyletic based on nuclear ribosomal DNA (18S-ITS1-5.8S-ITS2-26S). Ecological niche simulation showed overlap between the potential distribution areas of var. nivea and var. tenacissima, but neither overlapped with var. strigosa. These analyses collectively demonstrate the distinctiveness of var. strigosa, but mostly did not fully separate var. nivea from var. tenacissima. Hence var. strigosa is a biologically meaningful variety, but var. tenacissima should, be synonymised within var. nivea. These results should aid the breeding and improvement of new varieties of ramie, and highlights the value of integrative taxonomic methods in examining infraspecific subdivisions within species that include cultivated and feralized material.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».