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Enregistrement W4402958034 · doi:10.1101/2024.09.26.615281

ABA-regulated JAZ1 Proteins Bind NAC42 Transcription Factors to Suppress the Activation of Phytoalexin Biosynthesis in Plants

2024· preprint· en· W4402958034 sur OpenAlexafffund
Ivan Monsalvo, Md Asraful Jahan, Melissa Ly, Dasol Wi, Izabella Martirosyan, Israt Jahan, Nik Kovinich

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesUniversity of Toronto ScarboroughNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCollege of Engineering, Michigan State UniversityArizona Biomedical Research CommissionChina Scholarship CouncilUniversity of TorontoYork UniversityMichigan State University
Mots-clésPhytoalexinBiosynthesisTranscription factorTranscription (linguistics)Cell biologyChemistryBiologyBiochemistryGeneResveratrol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Phytoalexins are plant defense metabolites whose biosynthesis remains suppressed until elicited by a pathogen or stress, yet the mechanism of their suppression has remained elusive. The transcription factor GmNAC42-1 is an important and direct activator of the biosynthesis of glyceollin phytoalexins in soybean. Yet, without elicitation, overexpressing GmNAC42-1 is insufficient to activate the expression of glyceollin biosynthetic genes, suggesting that the activity of GmNAC42-1 may be suppressed by a negative regulator. JAZ1 proteins are negative regulators of the canonical jasmonic acid (JA) signaling pathway. JAZ protein degradation and JAZ gene transcription comprise antagonistic mechanisms that activate and suppress JA signaling, respectively. In search for negative regulators of glyceollin biosynthesis, we identified by RNA-seq analysis abscisic acid (ABA) signaling and GmJAZ1 genes that are oppositely regulated compared to glyceollin biosynthesis. Long-term ABA treatment upregulated GmJAZ1 transcripts, whereas its biosynthesis inhibitor fully suppressed their upregulation by dehydration stress. Opposite patterns were observed for glyceollin biosynthesis. RNAi silencing of GmJAZ1s prevented the suppression of glyceollin biosynthesis by dehydration and derepressed glyceollin synthesis in non-elicited tissues. Overexpressing GmJAZ1-9 in hairy roots elicited with Phytophthora sojae wall glucan elicitor partially suppressed glyceollin biosynthesis. The GmJAZ1-9 protein physically interacted with GmNAC42-1 and inhibited its transactivation and DNA binding activities in promoter-luciferase and yeast-three hybrid systems. Silencing JAZ1s in Arabidopsis and grapevine has been reported to derepress camalexin and stilbene phytoalexin biosynthesis. Here, we found that JAZ1 and NAC42 proteins from all three plant species physically interact, suggesting a conserved mechanism negatively regulates phytoalexin biosynthesis in plants. Abstract Figure

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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