Harnessing Big Heterogeneous Data to Evaluate the Potential Impact of HIV Responses Among Key Populations in Sub-Saharan Africa: Protocol for the Boloka Data Repository Initiative
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: In South Africa, there is no centralized HIV surveillance system where key populations (KPs) data, including gay men and other men who have sex with men, female sex workers, transgender persons, people who use drugs, and incarcerated persons, are stored in South Africa despite being on higher risk of HIV acquisition and transmission than the general population. Data on KPs are being collected on a smaller scale by numerous stakeholders and managed in silos. There exists an opportunity to harness a variety of data, such as empirical, contextual, observational, and programmatic data, for evaluating the potential impact of HIV responses among KPs in South Africa. OBJECTIVE: This study aimed to leverage and harness big heterogeneous data on HIV among KPs and harmonize and analyze it to inform a targeted HIV response for greater impact in Sub-Saharan Africa. METHODS: The Boloka data repository initiative has 5 stages. There will be engagement of a wide range of stakeholders to facilitate the acquisition of data (stage 1). Through these engagements, different data types will be collated (stage 2). The data will be filtered and screened to enable high-quality analyses (stage 3). The collated data will be stored in the Boloka data repository (stage 4). The Boloka data repository will be made accessible to stakeholders and authorized users (stage 5). RESULTS: The protocol was funded by the South African Medical Research Council following external peer reviews (December 2022). The study received initial ethics approval (May 2022), renewal (June 2023), and amendment (July 2024) from the University of Johannesburg (UJ) Research Ethics Committee. The research team has been recruited, onboarded, and received non-web-based internet ethics training (January 2023). A list of current and potential data partners has been compiled (January 2023 to date). Data sharing or user agreements have been signed with several data partners (August 2023 to date). Survey and routine data have been and are being secured (January 5, 2023). In (September 2024) we received Ghana Men Study data. The data transfer agreement between the Pan African Centre for Epidemics Research and the Perinatal HIV Research Unit was finalized (October 2024), and we are anticipating receiving data by (December 2024). In total, 7 abstracts are underway, with 1 abstract completed the analysis and expected to submit the full article to the peer-reviewed journal in early January 2024. As of March 2025, we expect to submit the remaining 6 full articles. CONCLUSIONS: A truly "complete" data infrastructure that systematically and rigorously integrates diverse data for KPs will not only improve our understanding of local epidemics but will also improve HIV interventions and policies. Furthermore, it will inform future research directions and become an incredible institutional mechanism for epidemiological and public health training in South Africa and Sub-Saharan Africa. INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): DERR1-10.2196/63583.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,188 | 0,226 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,005 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,006 | 0,006 |
| Communication savante | 0,008 | 0,006 |
| Science ouverte | 0,006 | 0,011 |
| Intégrité de la recherche | 0,006 | 0,009 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,089 | 0,021 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».