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Enregistrement W4403004771 · doi:10.1101/2024.09.29.615549

Evasion of neutrophil-mediated bacterial clearance in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> isolates from new-onset infections in cystic fibrosis children

2024· preprint· en· W4403004771 sur OpenAlexaff
Kelly Kwong, Sophia Goldman, Annie Beauchamp, Julien Malet, Inès Levade, L. Grana, David S. Guttman, Valerie Waters, Dao Nguyen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCystic fibrosisPseudomonas aeruginosaMicrobiologyImmunologyMedicinePseudomonasBiologyBacteriaInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Chronic Pseudomonas aeruginosa (PA) infections in cystic fibrosis (CF) patients can persist for decades and are associated with poor clinical outcomes. New-onset PA infections are routinely treated with antibiotics, but unfortunately up to 40% of patients fail eradication therapy due to reasons that are poorly understood. Recently, we found that Persistent PA isolates from CF patients who failed tobramycin eradication therapy were more resistant to in vitro neutrophil-mediated opsonophagocytosis and intracellular bacterial killing (OPK) and were significantly associated with a non-twitching phenotype compared to Eradicated isolates. In this study, we sought to investigate how Persistent isolates evade in neutrophil-mediated bacterial clearance in vitro and whether these PA isolates also persist in vivo . Furthermore, we investigated whether restoring pilus-mediated twitching motility is sufficient to restore susceptibility to in vitro OPK and in vivo bacterial clearance. Using primary murine serum and bone marrow-derived neutrophils, we demonstrated that Persistent isolates are resistant to several neutrophil antibacterial functions compared to Eradicated isolates. Additionally, mice failed to clear pulmonary infections caused by Persistent isolates but not Eradicated isolates despite comparable responses in leukocyte recruitment and cytokine responses. We demonstrate that loss of Type IV pilus-mediated twitching motility confers a fitness advantage for a Persistent isolate during a murine pulmonary infection, and restoration of pilus-mediated twitching motility improves in vivo bacterial clearance. Our findings show that resistance to neutrophil-mediated bacterial clearance in Persistent isolates are partly mediated by loss of Type IV pilus-dependent motility and contributes to the persistence of new onset PA infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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