Divergent roles of CPK28 in immune homeostasis across land plants
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Calcium-dependent protein kinases (CDPKs) decode cellular calcium transients and play diverse roles in plant growth and stress responses, including immunity. In Arabidopsis thaliana (At, Arabidopsis thereafter), AtCPK28 contributes to immune homeostasis by phosphorylating subgroup IV plant U-box proteins AtPUB22/24/25/26, which target the key immune receptor-like cytoplasmic kinase (RLCK) AtBIK1 for turnover. While this module is conserved in multiple angiosperms, it is unclear if the role of CPK28 in immune homeostasis is conserved more broadly across land plants. Here, we took an evolutionary comparative approach to understand the role of CPK28. We identified a single CPK28 ortholog in the liverwort Marchantia polymorpha , MpCPK28, which exhibits Ca 2+ -dependent kinase activity that is inhibited by calmodulin in vitro . We identified the subgroup IV plant U-box protein MpPUB20e as a substrate of MpCPK28. MpPUB20e is able to ubiquitinate MpPBLa, the functional ortholog of AtBIK1. We also provide preliminary evidence that MpPBLa undergoes proteasomal degradation in Marchantia, suggesting that optimization of MpPBLa protein accumulation is conserved across land plants. Interestingly, while loss of CPK28 function in multiple angiosperm species results in enhanced immune signaling, we find that Marchantia Mpcpk28 mutant alleles do not display enhanced immune-triggered production of reactive oxygen species or resistance to two pathogens. However, transgenic expression of MpCPK28 was able to restore function in Arabidopsis cpk28-1 mutants, suggesting latent functional conservation of MpCPK28. Furthermore, while AtCPK28-mediated phosphorylation of Thr95/94 on AtPUB25/26 is known to contribute to their activation, we could not observe a functional role for the equivalent residue Thr122 on MpPUB20e. Taken together, our results suggest that post-translational fine-tuning by CPK28 is likely to have refined the ‘PUB-BIK1’ module in the vascular plant lineages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».