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Enregistrement W4403040390 · doi:10.22541/au.172777624.46334222/v1

3D-cultured dermal fibroblasts self-produce a brain-like matrisome that promotes neurogenesis in silico and supports neuronal survival in vitro

2024· preprint· en· W4403040390 sur OpenAlexaff
Vincent Roy, Isabella Bienjonetti, Alexandre Paquet, François Gros‐Louis

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlanarian Biology and Electrostimulation
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIn silicoNeurogenesisIn vitroCell biologyBiologyMammalian brainNeuroscienceGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studying neurological disorders in vitro is still challenging due to the human brain’s complexity and the difficulty of obtaining primary neural cells. However, tissue engineering and tridimensional (3D) cell culture have become increasingly important tools for disease modeling. By providing an extracellular matrix (ECM) substrate that closely resembles physiological conditions, 3D cell culture offers several advantages over standard monolayer cell culture, including enhanced cell-cell and cell-matrix interactions. This results in a microenvironment that more accurately reflects in vivo biology. In this study, we performed an in-depth analysis of the proteome and matrisome of 3D tissue-engineered dermis, made from human primary dermal fibroblasts cultivated in 3D and embedded in a self-produced ECM. Interestingly, in silico analysis revealed that neurogenesis and associated functions were predicted to be strongly activated in this tissue-engineered 3D model. Indeed, we showed that ECM proteins involved in neuronal development and maintenance, typically produced by cerebral cells, were also expressed by dermal fibroblasts. Of particular interest, the 3D co-cultivation of dermal fibroblasts with iPSC-derived motor neurons readily enabled long-lasting culture periods without costly media supplementation with exogenous additives. Patient-derived dermal fibroblasts, cultivated in 3D, could therefore become valuable models for the study of neurological diseases. This approach offers a cost-effective and a less invasive alternative to brain biopsies for modeling complex neurological disorders in vitro.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,216
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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