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Enregistrement W4403044867 · doi:10.1016/j.isci.2024.111092

Identification and characterization of MADS-box gene family in flax, Linum usitatissimum L. and its role under abiotic stress

2024· article· en· W4403044867 sur OpenAlexaff
Jianyu Lu, Hanlu Wu, David Michael Pitt, Xin‐Yang Liu, Xixia Song, Hongmei Yuan, Yuntao Ma, Shuyao Li, Zhenyuan Zang, Jun Zhang, Michael K. Deyholos, Jian Zhang

Notice bibliographique

RevueiScience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensOkanagan University CollegeUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesJiangsu Provincial Department of Human Resources and Social SecurityJilin Agricultural University
Mots-clésLinumMADS-boxAbiotic stressIdentification (biology)GeneBiologyAbiotic componentGene familyGeneticsBotanyArabidopsisGene expressionEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h2>Summary</h2> MADS-box transcription factors play critical roles in plant development and stress responses. In this study, we identified 114 <i>LuMADS</i> genes in flax (<i>Linum usitatissimum</i> L.) and analyzed their phylogenetic relationships, gene structure, conserved motifs, miRNA targets, and expression patterns. We classified 45 <i>LuMADS</i> proteins as type I and 69 as type II, further subdivided into 11 subfamilies. Notably, lus-miR396 and lus-miR156 were identified as primary miRNA targets. <i>Cis</i>-acting elements in the promoter regions suggested roles in hormone and stress responses. Expression analysis revealed type II <i>LuMADS</i> genes were associated with floral organ formation and abiotic stresses such as cold, drought, and salt. This research provides insights for improving flax stress resistance and breeding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,769
Score d'incertitude au seuil0,094

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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