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Enregistrement W4403047690 · doi:10.1111/2041-210x.14415

Transparent reporting items for simulation studies evaluating statistical methods: Foundations for reproducibility and reliability

2024· article· en· W4403047690 sur OpenAlexaff
Coralie Williams, Yefeng Yang, Malgorzata Lagisz, Kyle Morrison, Lorenzo Ricolfi, David I. Warton, Shinichi Nakagawa

Notice bibliographique

RevueMethods in Ecology and Evolution · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilAustralian Research CouncilMedical Research Council
Mots-clésReproducibilityReliability (semiconductor)Computer scienceStatisticsReliability engineeringData miningData scienceMathematicsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Simulation studies are essential tools to assess statistical methods. Functioning as controlled experiments, simulations generate data from known underlying processes. However, unclear or incomplete reporting of simulation studies can impact their interpretability and reproducibility, potentially leading to the misuse of statistical methods. While Morris et al. (2019, Stat Med, 38, p. 2074) recently provided guidance on the planning and conduct of simulation studies for statistical method evaluation, there is currently no comprehensive set of reporting guidelines in ecology and evolutionary biology. Here, we propose 11 reporting items for statistical simulation studies extending on Morris and colleagues' guidance. These items span across three stages: planning, coding and analysis. We also clarify the terminology related to statistical components and the broad purposes of statistical simulation studies. To highlight our proposed reporting items with current practices, we surveyed 100 articles in ecology and evolution journals that included a simulation study evaluating a statistical method. Our survey found room for improvement in more transparent reporting to ensure clear evaluation of statistical methods. Most notably, only a small proportion of articles reported a Monte Carlo uncertainty (17%; 17 out of 98), and 32% (32 out of 100) articles did not provide code. Beyond the proposed reporting items, we discuss the benefits of open science tools to enhance the reproducibility of simulation studies. Specifically, we propose the registration of statistical simulation studies to enhance planning, reporting and collaboration. We aim to instigate discussions to improve the reporting of simulation studies for statistical method research. The reporting items we propose, along with open science tools, serve as a template for developing standards and guidelines for simulation studies evaluating statistical methods. These reporting guidelines will help enhance reproducibility and indirectly encourage more consideration in the design and conduct of these simulation studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,022
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,032
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,435
Score d'incertitude au seuil0,976

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0220,032
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,342
Tête enseignante GPT0,569
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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