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Enregistrement W4403065291 · doi:10.3390/ijms251910637

Comparison of Mitochondrial Genome Expression Differences among Four Skink Species Distributed at Different Latitudes under Low-Temperature Stress

2024· article· en· W4403065291 sur OpenAlexaff
Lemei Zhan, Jingyi He, Lingyi Ding, Kenneth B. Storey, Jia‐Yong Zhang, Dan‐Na Yu

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésEctothermSkinkBiologyLatitudeLizardEcologyBiodiversityInvertebrateGeneZoologyPhenotypic plasticityTranscriptomeEvolutionary biologyGene expressionGeneticsGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Continual climate change strongly influences temperature conditions worldwide, making ectothermic animals as suitable species for studying the potential impact of climate change on global biodiversity. However, the study of how lizards distributed at different latitudes respond to climate change at the transcriptome level is still insufficient. According to the Climatic Variability Hypothesis (CVH), the range of climate fluctuations experienced by terrestrial animals throughout the year increases with latitude, so individuals at higher latitudes should exhibit greater thermal plasticity to cope with fluctuating environments. Mitochondria, as the energy center of vertebrate cells, may indicate species’ plasticity through the sensitivity of gene expression. In this study, we focused on the changes in transcript levels of liver mitochondrial protein-coding genes (PCGs) in skinks from the genus Plestiodon (P. capito and P. elegans) and the genus Scincella (S. modesta and S. reevesii) under low-temperature conditions of 8 °C, compared to the control group at 25 °C. Species within the same genus of skinks exhibit different latitudinal distribution patterns. We found that the two Plestiodon species, P. elegans and P. capito, employ a metabolic depression strategy (decreased transcript levels) to cope with low temperatures. In contrast, the two Scincella species show markedly different patterns: S. modesta exhibits significant increases in the transcript levels of six genes (metabolic compensation), while in S. reevesii, only two mitochondrial genes are downregulated (metabolic depression) compared to the control group. We also found that P. capito and S. modesta, which live at mid-to-high latitudes, exhibit stronger adaptive responses and plasticity at the mitochondrial gene level compared to P. elegans and S. reevesii, which live at lower latitudes. We suggest that this enhanced adaptability corresponds to more significant changes in a greater number of genes (plasticity genes).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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