A global database of soil seed bank richness, density, and abundance
Notice bibliographique
Résumé
A soil seed bank is the collective name for viable seeds that are stored naturally in the soil. At the species or population level, the ability to form a seed bank represents a strategy for (re)colonization following a disturbance or other change in the local environmental conditions. At the community level, seed banks are thought to buffer local diversity during periods of environmental change and are often studied in relation to the potential for passive habitat restoration. The role that seed banks play in plant population and community dynamics, as well as their importance in the agricultural sector, means that they have been widely studied in ecological research. This database is the result of a comprehensive literature search, including all seed bank studies from the Web of Science from which data could be extracted, as well as an additional search of the Russian language literature. The database contains information on the species richness, seed density, and/or seed abundance in 3096 records from at least 1929 locations across the world's seven continents, extracted from 1442 studies published between 1940 and 2020. Records are grouped into five broad habitat categories (aquatic, arable, forest, grassland-including shrubland-and wetland), including information relating to habitat degradation from, or restoration to other habitats (total 14 combinations). Sampling protocols were also extracted for each record, and the database was extensively checked for errors. The location of each record was then used to extract summary climate data and biome classification from external published databases. The database has several potential uses. The large geographical spread relative to many other global biodiversity datasets is relevant for investigating patterns of diversity in biogeographical or macroecological contexts. Habitat type and status (intact, degraded, and restored) can be used to provide insights for biodiversity conservation, while the potential effects of sampling method and effort can be used to inform optimized data collection for future seed bank studies. This database is released under the CC-BY license.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,029 | 0,031 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,025 | 0,014 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».