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Enregistrement W4403077761 · doi:10.1101/2024.10.01.616079

CK1α, FAM83H, and FAM83B contribute to bundling of neurofilaments and are sequestered in cellular and mice models of ARSACS

2024· preprint· en· W4403077761 sur OpenAlexafffundabout
Caitlin S. Atkinson, Zacharie Cheng-Boivin, Nancy Larochelle, Sandra Minotti, Benoît J. Gentil

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMuscular Dystrophy Canada
Mots-clésCell biologyNeurofilamentNeuroscienceChemistryBiologyImmunologyImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Autosomal recessive spastic ataxia of the Charlevoix-Saguenay (ARSACS) is a rare neurodegenerative disorder characterized by mutations in the SACS gene that encodes for the sacsin protein. Sacsin dysfunction in ARSACS results in neurofilament bundling, a phenotype observed in various cellular models of ARSACS. The mechanisms underlying bundling in ARSACS remain unclear. With neurofilament phosphorylation controlling several processes of intermediate filament dynamics, its dysregulation may play a role in ARSACS. Accordingly, we investigated the interaction between CK1α (Casein Kinase 1α) and its adaptor proteins FAM83H or FAM83B (FAMily with sequence similarity 83). Here, we report that these target proteins are upregulated in ARSACS patient fibroblasts and co-localize at the sites of intermediate filament bundling. In the Sacs -/- cerebellum, FAM83B compensated for the lack of FAM83H expression, suggesting a cell-type specific activity of CK1α that depends on the relative expression of its adaptor proteins. Further, CK1α inhibition with D4475 or knockdown of the target proteins with the CRISPR system caused neurofilament bundling, a phenotype that was only partially remedied by CK1α activation with SSTC3. Our findings suggest that CK1α, FAM83H, and FAM83B contribute to neurofilament bundling in ARSACS; however, the inability of CK1α to resolve neurofilament bundling may reflect an error in a priming phosphorylation event in ARSACS. Future research is needed to understand the hierarchical phosphorylation cascade to CK1α activity and its contribution to ARSACS pathology. Highlights CK1α and its cell-specific adaptors are upregulated in ARSACS and targeted to the sites of bundles Knockdown of CK1α, FAM83H, and FAM83B cause neurofilament bundling Activation of CK1α partially remediates bundling

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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