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Enregistrement W4403082984 · doi:10.1021/acs.jpcb.4c04929

Probing the Closed Association of Oligoquinoline Foldamers by Time-Resolved Fluorescence Anisotropy

2024· article· en· W4403082984 sur OpenAlexafffund
Kristijan Lulic, Jingqi Wang, Xuesong Li, Nagula Markandeya, Ivan Huc, Victor Maurizot, Jean Duhamel

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChemical Synthesis and Analysis
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Waterloo
Mots-clésAssociation (psychology)FluorescenceAnisotropyFluorescence anisotropyChemistryMaterials scienceOpticsPhysicsPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The metal-mediated dimerization of oligoquinoline foldamers terminated at one end with an oligo(phenylenevinylene) and at the other with a carboxylic acid (OPV-Q n A, where n = 4, 8, 17, and 33), and the complexation of OPV-Q 8 A and Q 16 A was promoted in chloroform by the addition of a concentrated 16 M aqueous sodium hydroxide solution. UV–vis absorption and time-resolved fluorescence anisotropy (TRFA) experiments were conducted to determine, respectively, the concentration and the average rotational time ⟨ϕ⟩ of the mixture of unassociated and associated foldamers across a range of foldamer concentrations spanning 5 orders of magnitude. Plots of ⟨ϕ⟩ as a function of acid group concentration revealed that ⟨ϕ⟩ increased with increasing foldamer concentration only when the foldamer solution in chloroform was vigorously mixed with the 16 M sodium hydroxide aqueous solution. Furthermore, all plots showed that ⟨ϕ⟩ reached a plateau at high foldamer concentration. The increase in ⟨ϕ⟩ reflected the association of foldamers into larger objects through metal ion coordination with the carboxylate anions generated by deprotonation of the carboxylic acid of OPV-Q n A with NaOH, while the plateau obtained at high foldamer concentration indicated that these interactions led to the dimerization of the foldamers via a closed association mechanism. Analysis of the ⟨ϕ⟩ trends yielded the equilibrium constants ( K ) describing the foldamer dimerization, whose value equaled 1.0 (±0.2) × 10 6 M –1 for the three longer OPV-Q n A foldamers, but was about 10 times smaller for the shortest one ( n = 4). Association of OPV-Q 8 A and Q 16 A yielded a complex with a ⟨ϕ⟩ matching that of OPV-Q 24 A, and K for this complexation was similar to that for dimerization. These experiments illustrate the robust nature of TRFA as an experimental method to probe the size of rigid, self-assembled foldamers in solution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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