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Enregistrement W4403086678 · doi:10.1101/2024.09.30.24314653

Development, Testing, and Calibration of LINCS: A New Microsimulation Model of Maternal and Fetal Cytomegalovirus Infection in the US

2024· preprint· en· W4403086678 sur OpenAlexaffabout
Aaron S Wu, Elif Coskun, Malavika Prabhu, Emily M Santos, Fatima Kakkar, Clare Flanagan, Caitlin M. Dugdale, Megan H. Pesch, John Giardina, Andrea Ciaranello

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrosimulationCytomegalovirusCalibrationCytomegalovirus infectionsVirologyFetusMedicinePregnancyHuman cytomegalovirusBiologyEngineeringVirusViral diseaseHerpesviridaeStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background Congenital cytomegalovirus (cCMV) is a leading cause of birth defects and the most common cause of non-genetic sensorineural hearing loss in children. There is a lack of decision modeling frameworks that can project cytomegalovirus (CMV)-related patient outcomes and inform health policy. We created, tested, and calibrated a model of CMV acquisition and transmission in pregnancy using linked mother-infant dyads. Methods We developed the L inking IN fants and Mothers in C ytomegalovirus S imulation (LINCS) dyad-level Monte-Carlo microsimulation model of CMV infection among pregnant people and fetuses throughout pregnancy. We parameterized the model with data from the US, Canada and the EU from the existing literature, implemented rigorous code testing procedures, and calibrated a key set of parameters to match model output to external data on cCMV prevalence and symptom risk. Results A fully parameterized model for CMV among pregnant people and fetuses was developed, and the model code was confirmed to perform as specified. The calibration procedure identified parameter sets that generated model output closely matching the target values from the available data on cCMV prevalence and symptom risk. Conclusions The LINCS model’s ability to simulate the natural history of CMV infection during pregnancy was described and demonstrated, and the model was tested and calibrated to ensure proper functioning. Base case parameters were derived for CMV infection natural history to be used in future decision analyses of CMV testing and treatment strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,123
Score d'incertitude au seuil0,244

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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