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Enregistrement W4403090916 · doi:10.1021/acs.jmedchem.4c01041

An Adenosine Analogue Library Reveals Insights into Active Sites of Protein Arginine Methyltransferases and Enables the Discovery of a Selective PRMT4 Inhibitor

2024· article· en· W4403090916 sur OpenAlexafffund
Youchao Deng, Eui‐Jun Kim, Xiaosheng Song, Akshay S. Kulkarni, Ryan X. Zhu, Yidan Wang, Michelle Bush, Aiping Dong, Nicholas Noinaj, Jinrong Min, Wei Xu, Rong Huang

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDr. Ralph and Marian Falk Medical Research TrustRalph W. and Grace M. Showalter Research Trust FundPurdue University
Mots-clésChemistryMethyltransferaseAdenosineArginineBiochemistryMethylationAmino acidDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein arginine methyltransferases (PRMTs) represent promising drug targets. However, the lack of isoform-selective chemical probes poses a significant hurdle in deciphering their biological roles. To address this issue, we devised a library of 100 diverse adenosine analogues, enabling a detailed exploration of the active site of PRMTs. Despite their close homology, our analysis unveiled specific chemical trends unique to the individual members. Notably, compound YD1130 demonstrated over 1000-fold selectivity for PRMT4 (IC 50 < 0.5 nM) over a panel of 38 methyltransferases, including the other PRMTs. Its prodrug YD1342 exhibited potent inhibition on cellular substrate methylation, breast cancer cell colony formation, and tumor growth in the animal model, surpassing or matching known PRMT4-specific inhibitors. In summary, our focused library not only illuminates the intricate active sites of PRMTs to facilitate the discovery of highly potent and isoform-selective probes but also offers a versatile blueprint for identifying chemical probes for other methyltransferases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,380

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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