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Enregistrement W4403092544 · doi:10.1371/journal.pone.0311519

Functional comparison of human and murine equilibrative nucleobase transporter 1

2024· article· en· W4403092544 sur OpenAlexafffund
Chan S. Kim, Aaron L. Sayler, Nicholas M. Ruel, James R. Hammond

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNucleobaseTransporterBiologyComputational biologyGeneticsDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

6-Mercaptopurine (6-MP) maintenance therapy is the mainstay for various types of leukemia and inflammatory bowel disease. 6-MP is associated with numerous adverse effects including gastrointestinal intolerance, myelotoxicity, and hepatotoxicity. This can lead to therapy discontinuation which is associated with a higher risk of relapse. Drug transporter expression is a known factor contributing to patient variability in drug response and toxicity. We have established that the SLC43A3-encoded equilibrative nucleobase transporter 1 (ENBT1) mediates the transport of 6-MP into human lymphocytes and human embryonic kidney 293 (HEK293) cell lines transfected with SLC43A3. ENBT1 is known to be expressed in the gastrointestinal tract, bone marrow, and the liver. However, the relationship between ENBT1 and 6-MP-associated adverse events, and its pharmacokinetics, is unknown. To validate the use of mouse models (e.g. slc43a3-null mice) for exploring this relationship, we assessed the functional similarities between human and murine ENBT1 using HEK293 cells transfected with the respective SLC43A3/slc43a3 constructs, and the leukemia cell lines MOLT-4 (human) and L1210 (murine). Based on in silico analyses of structural similarities between transporters, we hypothesized that human and murine ENBT1 will have similar 6-MP transport/inhibition kinetics and a similar impact on 6-MP-induced cytotoxicity. We show herein that mslc43a3-encoded mouse ENBT1 transports both [3H]6-MP and [3H]adenine with kinetics similar to those of hSLC43A3-encoded human ENBT1. Both are also similarly distributed in mouse and human tissues. Therefore, data obtained from mouse models where ENBT1 is disrupted or modified may provide clinically relevant insights on its roles in modulating the actions of 6-MP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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