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Enregistrement W4403097293 · doi:10.1183/13993003.00907-2024

Residential exposure to<i>Aspergillus</i>spp<i>.</i>is associated with exacerbations in COPD

2024· article· en· W4403097293 sur OpenAlexafffundabout
Pei Yee Tiew, Janice M. Leung, Micheál Mac Aogáin, P. Johal, Tavleen Kaur Jaggi, Agnes Che Yan Yuen, Fransiskus Xaverius Ivan, Julia Yang, Tina Afshar, Augustine Tee, Mariko Siyue Koh, Yee Hui Lim, Anthony Wong, Lakshmi Chandrasekaran, Justine Dacanay, Daniela I. Drautz‐Moses, Thun How Ong, John Abisheganaden, Fook Tim Chew, Stephan C. Schuster, Christopher Carlsten, Sanjay H. Chotirmall

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueIndoor Air Quality and Microbial Exposure
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesSingapore Immunology NetworkImam Abdulrahman Bin Faisal UniversityMedical Research Council CanadaMedical Research CouncilMinistry of Education, IndiaCanada Research ChairsAgency for Science, Technology and ResearchNational Research Foundation SingaporeBiomedical Research CouncilNational Medical Research CouncilNational Research FoundationNational University of SingaporeINOVIO PharmaceuticalsLee Kong Chian School of Medicine, Nanyang Technological UniversityChiesi FarmaceuticiAstraZenecaCSL BehringMinistry of Education - SingaporeGenome British ColumbiaSingapore Food Agency
Mots-clésMedicineCOPDAspergillusEnvironmental healthIntensive care medicineMicrobiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Sensitisation toAspergillus fumigatusis linked to worse outcomes in patients with COPD; however, its prevalence and clinical implications in domestic (residential) settings remains unknown. Methods Individuals with COPD (n=43) recruited in Singapore had their residences prospectively sampled and assessed by shotgun metagenomic sequencing including indoor air, outdoor air and touch surfaces (a total of 126 specimens). The abundance of environmentalA. fumigatusand the occurrence ofA. fumigatus(Asp f) allergens in the environment were determined and immunological responses toA. fumigatusallergens determined in association with clinical outcomes including exacerbation frequency. Findings were validated in 12 individuals (31 specimens) with COPD in Vancouver, Canada, a climatically different region. Results 157 metagenomes from 43 homes were assessed. 11 and nine separateAspergillusspp.were identified in Singapore and Vancouver, respectively. Despite climatic, temperature and humidity variation,A. fumigatuswas detectable in the environment from both locations. The relative abundance of environmentalA. fumigatuswas significantly associated with exacerbation frequency in both Singapore (r=0.27, p=0.003) and Vancouver (r=0.49, p=0.01) and individuals with higher Asp f 3 sensitisation responses lived in homes with a greater abundance of environmental Asp f 3 allergens (p=0.037). Patients exposed and sensitised to Asp f 3 allergens demonstrated a higher rate of COPD exacerbations at 1-year follow-up (p=0.021). Conclusion EnvironmentalA. fumigatusexposure in the home environment including air and surfaces with resulting sensitisation carries pathogenic potential in individuals with COPD. Targeting domesticA. fumigatusabundance may reduce COPD exacerbations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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