Residential exposure to<i>Aspergillus</i>spp<i>.</i>is associated with exacerbations in COPD
Notice bibliographique
Résumé
Background Sensitisation toAspergillus fumigatusis linked to worse outcomes in patients with COPD; however, its prevalence and clinical implications in domestic (residential) settings remains unknown. Methods Individuals with COPD (n=43) recruited in Singapore had their residences prospectively sampled and assessed by shotgun metagenomic sequencing including indoor air, outdoor air and touch surfaces (a total of 126 specimens). The abundance of environmentalA. fumigatusand the occurrence ofA. fumigatus(Asp f) allergens in the environment were determined and immunological responses toA. fumigatusallergens determined in association with clinical outcomes including exacerbation frequency. Findings were validated in 12 individuals (31 specimens) with COPD in Vancouver, Canada, a climatically different region. Results 157 metagenomes from 43 homes were assessed. 11 and nine separateAspergillusspp.were identified in Singapore and Vancouver, respectively. Despite climatic, temperature and humidity variation,A. fumigatuswas detectable in the environment from both locations. The relative abundance of environmentalA. fumigatuswas significantly associated with exacerbation frequency in both Singapore (r=0.27, p=0.003) and Vancouver (r=0.49, p=0.01) and individuals with higher Asp f 3 sensitisation responses lived in homes with a greater abundance of environmental Asp f 3 allergens (p=0.037). Patients exposed and sensitised to Asp f 3 allergens demonstrated a higher rate of COPD exacerbations at 1-year follow-up (p=0.021). Conclusion EnvironmentalA. fumigatusexposure in the home environment including air and surfaces with resulting sensitisation carries pathogenic potential in individuals with COPD. Targeting domesticA. fumigatusabundance may reduce COPD exacerbations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».