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Enregistrement W4403110520 · doi:10.1523/jneurosci.1236-24.2024

Large-Scale Mechanistic Models of Brain Circuits with Biophysically and Morphologically Detailed Neurons

2024· review· en· W4403110520 sur OpenAlexafffund
Salvador Durá-Bernal, Beatriz Herrera, Carmen Alina Lupaşcu, Brianna Marsh, Daniela Gandolfi, Addolorata Marasco, Samuel A. Neymotin, Armando Romani, Sergio Solinas, Maxim Bazhenov, Etay Hay, Michele Migliore, Michael Reinmann, Anton Arkhipov

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2024
Typereview
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesArmy Research OfficeNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringÉcole Polytechnique Fédérale de LausanneNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthKrembil FoundationHORIZON EUROPE Framework ProgrammeBoard of the Swiss Federal Institutes of TechnologyEuropean CommissionNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésNeuroscienceComputer scienceComputational neuroscienceConnectomeNeuroinformaticsComputational modelNeuroimagingBrain activity and meditationBiological neural networkBrain stimulationMagnetoencephalographyElectroencephalographyPsychologyArtificial intelligenceFunctional connectivity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding the brain requires studying its multiscale interactions from molecules to networks. The increasing availability of large-scale datasets detailing brain circuit composition, connectivity, and activity is transforming neuroscience. However, integrating and interpreting this data remains challenging. Concurrently, advances in supercomputing and sophisticated modeling tools now enable the development of highly detailed, large-scale biophysical circuit models. These mechanistic multiscale models offer a method to systematically integrate experimental data, facilitating investigations into brain structure, function, and disease. This review, based on a Society for Neuroscience 2024 MiniSymposium, aims to disseminate recent advances in large-scale mechanistic modeling to the broader community. It highlights (1) examples of current models for various brain regions developed through experimental data integration; (2) their predictive capabilities regarding cellular and circuit mechanisms underlying experimental recordings (e.g., membrane voltage, spikes, local-field potential, electroencephalography/magnetoencephalography) and brain function; and (3) their use in simulating biomarkers for brain diseases like epilepsy, depression, schizophrenia, and Parkinson's, aiding in understanding their biophysical underpinnings and developing novel treatments. The review showcases state-of-the-art models covering hippocampus, somatosensory, visual, motor, auditory cortical, and thalamic circuits across species. These models predict neural activity at multiple scales and provide insights into the biophysical mechanisms underlying sensation, motor behavior, brain signals, neural coding, disease, pharmacological interventions, and neural stimulation. Collaboration with experimental neuroscientists and clinicians is essential for the development and validation of these models, particularly as datasets grow. Hence, this review aims to foster interest in detailed brain circuit models, leading to cross-disciplinary collaborations that accelerate brain research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,798
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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