Environmental DNA (eDNA) as a tool to detect Arctic grayling and their habitat preferences in the Northwest Territories, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Environmental deoxyribonucleic acid (eDNA) assays represent a non-invasive approach for biomonitoring. To assess Arctic grayling ( Thymallus arcticus, Pallas, 1776) populations in the Little Nahanni watershed of Northwest Territories, Canada, an eDNA assay that has been previously validated for use in fish of the Beringia lineage was used in conjunction with traditional survey methods (i.e., electrofishing). Forty-six 100 m reaches of streams were assessed in August 2015. The assay successfully detected Arctic grayling of the Nahanni lineage, with an eDNA signal recorded at each of the 17 sites in which Arctic grayling were observed by traditional fish surveys, but also at 3 of the 29 sites where Arctic grayling were not observed. The presence of eDNA was related to habitat metrics via Random Forest and correlation analyses. Riffles and water temperature were identified as being predictive of Arctic grayling eDNA abundance; however, no significant relationship between eDNA abundance and biomass proxies (fish abundance and fork length metrics) could be established. The high congruence between traditional approaches and eDNA surveys suggests adoption of the latter method will enhance the temporal and spatial acuity of biomonitoring, thereby improving field assessment of Arctic grayling populations and contributing towards more effective conservation management of this species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».