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Enregistrement W4403130090 · doi:10.1016/j.xcrm.2024.101758

CDK12 loss drives prostate cancer progression, transcription-replication conflicts, and synthetic lethality with paralog CDK13

2024· article· en· W4403130090 sur OpenAlexaff
Jean C. Tien, Jie Luo, Yu Chang, Yuping Zhang, Yunhui Cheng, Xiaoju Wang, Jianzhang Yang, Rahul Mannan, Somnath Mahapatra, Palak Shah, Xiaoming Wang, Abigail J. Todd, Sanjana Eyunni, Caleb Cheng, Ryan J. Rebernick, Lanbo Xiao, Yi Bao, James Neiswender, Rachel Brough, Stephen J. Pettitt, Xuhong Cao, Stephanie J. Miner, Licheng Zhou, Yi‐Mi Wu, Estefanía Labanca, Yuzhuo Wang, Abhijit Parolia, Marcin Cieślik, Dan R. Robinson, Zhen Wang, Felix Y. Feng, Jonathan Chou, Christopher J. Lord, Ke Ding, Arul M. Chinnaiyan

Notice bibliographique

RevueCell Reports Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensVancouver General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Natural Science Foundation of ChinaUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterNational Cancer InstituteProstate Cancer FoundationCancer Research UKU.S. Department of Defense
Mots-clésLethalitySynthetic lethalityProstate cancerReplication (statistics)BiologyTranscription (linguistics)Cancer researchGeneticsCancerVirologyDNA repairGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biallelic loss of cyclin-dependent kinase 12 ( CDK12 ) defines a metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC) subtype. It remains unclear, however, whether CDK12 loss drives prostate cancer (PCa) development or uncovers pharmacologic vulnerabilities. Here, we show Cdk12 ablation in murine prostate epithelium is sufficient to induce preneoplastic lesions with lymphocytic infiltration. In allograft-based CRISPR screening, Cdk12 loss associates positively with Trp53 inactivation but negatively with Pten inactivation. Moreover, concurrent Cdk12 / Trp53 ablation promotes proliferation of prostate-derived organoids, while Cdk12 knockout in Pten -null mice abrogates prostate tumor growth. In syngeneic systems, Cdk12 / Trp53 -null allografts exhibit luminal morphology and immune checkpoint blockade sensitivity. Mechanistically, Cdk12 inactivation mediates genomic instability by inducing transcription-replication conflicts. Strikingly, CDK12 -mutant organoids and patient-derived xenografts are sensitive to inhibition or degradation of the paralog kinase, CDK13. We therein establish CDK12 as a bona fide tumor suppressor, mechanistically define how CDK12 inactivation causes genomic instability, and advance a therapeutic strategy for CDK12- mutant mCRPC. • Cdk12 ablation induces preneoplastic prostate lesions with T cell infiltration • Cdk12 loss mediates genomic instability through transcription-replication conflicts • Cdk12 / Trp53 knockout in murine allografts sensitizes to immune checkpoint blockade • CDK12 loss sensitizes paralog-based synthetic lethality via targeting CDK13 Tien et al. employ mouse models to define Cdk12 as a bona fide prostate cancer tumor suppressor gene. Cdk12 loss promotes transcription-replication conflicts, inducing DNA damage. Murine and human prostate tumors with inactive CDK12 exhibit paralog-based synthetic lethality upon pharmacologic targeting of CDK13—a strategy with potential clinical application.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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