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Enregistrement W4403133736 · doi:10.1128/cmr.00106-24

Antibiotic tolerance among clinical isolates: mechanisms, detection, prevalence, and significance

2024· review· en· W4403133736 sur OpenAlexfundno aff
Ashley T. Deventer, Claire E. Stevens, Amy Stewart, Joanne K. Hobbs

Notice bibliographique

RevueClinical Microbiology Reviews · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversität Basel
Mots-clésAntibioticsClinical significanceMedicineBiologyMicrobiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Antibiotic treatment failures in the absence of resistance are not uncommon. Recently, attention has grown around the phenomenon of antibiotic tolerance, an underappreciated contributor to recalcitrant infections first detected in the 1970s. Tolerance describes the ability of a bacterial population to survive transient exposure to an otherwise lethal concentration of antibiotic without exhibiting resistance. With advances in genomics, we are gaining a better understanding of the molecular mechanisms behind tolerance, and several studies have sought to examine the clinical prevalence of tolerance. Attempts have also been made to assess the clinical significance of tolerance through in vivo infection models and prospective/retrospective clinical studies. Here, we review the data available on the molecular mechanisms, detection, prevalence, and clinical significance of genotypic tolerance that span ~50 years. We discuss the need for standardized methodology and interpretation criteria for tolerance detection and the impact that methodological inconsistencies have on our ability to accurately assess the scale of the problem. In terms of the clinical significance of tolerance, studies suggest that tolerance contributes to worse outcomes for patients (e.g., higher mortality, prolonged hospitalization), but historical data from animal models are varied. Furthermore, we lack the necessary information to effectively treat tolerant infections. Overall, while the tolerance field is gaining much-needed traction, the underlying clinical significance of tolerance that underpins all tolerance research is still far from clear and requires attention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,385
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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