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Enregistrement W4403136843 · doi:10.26434/chemrxiv-2024-sc6gq

MALDI-2 Mass Spectrometry Imaging enables spatial visualization of endocannabinoids in brain

2024· preprint· en· W4403136843 sur OpenAlexaff
Emanuela Salviati, Francesca Guida, Danila La Gioia, Fabrizio Merciai, Sabatino Maione, Vincenzo Di Marzo, Pietro Campiglia, Fabiana Piscitelli, Eduardo Sommella

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesMinistero dell'Università e della Ricerca
Mots-clésMass spectrometry imagingEndocannabinoid systemMass spectrometryVisualizationNeuroimagingChemistryNeuroscienceComputer scienceComputational biologyChromatographyPsychologyArtificial intelligenceBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endocannabinoids (eCBs) are endogenous lipid messengers that primarily bind cannabinoid receptors CB1/CB2 and together with the enzymes that regulate their biosynthesis and degradation define the endocannabinoid system. The eCB signaling system plays a key role in the central nervous system, resulting altered in most neurological disorders. The analysis of eCBs is challenging for their low concentration in biospecimens, and this is exacerbated in Mass Spectrometry Imaging (MSI) where low sensitivity and tissue dependent ion suppression obscure their spatial visualization. In this work we address this limitation by the application of laser-induced post-ionization (MALDI-2). Herein we demonstrate that MALDI-2 boosts the detection of 2-arachidonylglycerol (2-AG) and N-acylethanolamines (AEA, PEA, OEA) with respect to MALDI, and that eCBs can be visualized in brain at endogenous concentration only by MALDI-2-MSI. Both root-mean-square (RMS) and deuterated internal standards (I.S.) normalization were evaluated, with I.S. normalization providing improved pixel to pixel variation and more uniform distribution in specific brain regions, especially for 2-AG and PEA. Furthermore, high lateral resolution up to 5 µm pixel size was evaluated, resulting in the detection of all eCBs and confirming the MALDI-2 potential even reducing the ablated tissue amount. Lastly the method was applied as proof of concept in a mouse model of mild traumatic brain injury demonstrating the ability to reveal valuable biological insights for neuropharmacology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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