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Enregistrement W4403136932 · doi:10.1038/s41561-024-01560-9

Inhibition of phototrophic iron oxidation by nitric oxide in ferruginous environments

2024· article· en· W4403136932 sur OpenAlexaff
Verena Nikeleit, Adrian Mellage, Giorgio Bianchini, Lea Sauter, Steffen Buessecker, Stefanie Gotterbarm, Manuel Schad, Kurt O. Konhauser, Aubrey L. Zerkle, Patricia Sánchez‐Baracaldo, Andreas Kappler, Casey Bryce

Notice bibliographique

RevueNature Geoscience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueHydrocarbon exploration and reservoir analysis
Établissements canadiensInnovation Cluster (Canada)University of Alberta
Organismes subventionnairesUniversity of BristolRoyal SocietyArizona State UniversityDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Aeronautics and Space Administration
Mots-clésPhototrophNitric oxideEnvironmental chemistryEnvironmental scienceGeologyChemistryPaleontologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anoxygenic phototrophic Fe(II) oxidizers (photoferrotrophs) are thought to have thrived in Earth's ancient ferruginous oceans and played a primary role in the precipitation of Archaean and Palaeoproterozoic (3.8-1.85-billion-year-old) banded iron formations (BIFs). The end of BIF deposition by photoferrotrophs has been interpreted as the result of a deepening of water-column oxygenation below the photic zone, concomitant with the proliferation of cyanobacteria. However, photoferrotrophs may have experienced competition from other anaerobic Fe(II)-oxidizing microorganisms, altering the formation mechanism of BIFs. Here we utilize microbial incubations to show that nitrate-reducing Fe(II) oxidizers metabolically outcompete photoferrotrophs for dissolved Fe(II). Moreover, both experiments and numerical modelling show that the nitrate-reducing Fe(II) oxidizers inhibit photoferrotrophy via the production of toxic intermediates. Four different photoferrotrophs, representing both green sulfur and purple non-sulfur bacteria, are susceptible to this toxic effect despite having genomic capabilities for nitric oxide detoxification. Indeed, despite nitric oxide detoxification mechanisms being ubiquitous in some groups of phototrophs at the genomic level (for example, Chlorobi and Cyanobacteria) it is likely that they would still be affected. We suggest that the production of reactive nitrogen species during nitrate-reducing Fe(II) oxidation in ferruginous environments may have inhibited the activity of photoferrotrophs in the ancient oceans and thus impeded their role in the precipitation of BIFs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,720
Score d'incertitude au seuil0,322

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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