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Enregistrement W4403138252 · doi:10.1016/j.nmd.2024.07.257

50P Monoallelic DAG1 truncating variants in patients with hyperCKemia

2024· article· en· W4403138252 sur OpenAlexaff
Alba Segarra‐Casas, Christina Trainor, Kiran Polavarapu, J. Díaz-Manera, L. Gonzalez-Quereda, J. Kirschner, A. Nascimento, Andreas Roos, JE Dowling, F. Muntoni, Ana Töpf, V. Straub

Notice bibliographique

RevueNeuromuscular Disorders · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dystroglycan is an essential component of the dystrophin-glycoprotein complex that links the actin-associated cytoskeleton to the extracellular matrix (ECM). Dystroglycan, encoded by the DAG1 gene, is proteolytically cleaved into α-Dystroglycan, a highly glycosylated protein that binds to ECM ligands, and β-Dystroglycan, a transmembrane protein non-covalently linked to α-Dystroglycan. Biallelic variants in DAG1 cause primary dystroglycanopathies with a wide phenotypic variability. Through exome sequencing we identified heterozygous truncating DAG1 variants in 18 individuals from 10 unrelated families. Five variants were stop gains and five were frameshift; with the majority localized in α-Dystroglycan (90%). Segregation analysis was available for seven families, with one variant being de novo, three dominantly inherited and three inherited from an asymptomatic parent. WGS performed in six patients excluded the presence of additional deep intronic DAG1 variants. The most common clinical features were the presence of high CK levels (18/18), myalgia (9/18) and muscle hypertrophy (3/18). Mild levels of learning or social difficulties were also observed in some patients (4/18). Histological analysis was performed in eight patients and showed the presence of mild dystrophic or myopathic changes. Dystroglycan immunostaining, either β-Dystroglycan or α-Dystroglycan, was reduced in four out of five patients. RNAseq data from muscle biopsies from two unrelated patients showed the expression of both wild-type and truncated alleles, indicating that nonsense-mediated decay is not triggered by these alleles. To date, few studies have reported the presence of heterozygous truncating DAG1 variants in asymptomatic or pauci-symptomatic individuals. Here, we describe 18 additional individuals with AD DAG1 hyperCKemia with mild muscular manifestations. Expression of both the truncated and wild-type alleles argues against haploinsufficiency as the underlying pathomechanisms in DAG1 -AD individuals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,164
Score d'incertitude au seuil0,592

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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