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Enregistrement W4403143666 · doi:10.1016/j.xcrm.2024.101755

De novo GTP synthesis is a metabolic vulnerability for the interception of brain metastases

2024· article· en· W4403143666 sur OpenAlex
Agata Kieliszek, Daniel Mobilio, Blessing Bassey‐Archibong, Jarrod W. Johnson, Mathew L Piotrowski, Elvin D. de Araujo, Abootaleb Sedighi, Nikoo Aghaei, Laura Escudero, P T Ang, William D. Gwynne, Cunjie Zhang, Andrew T. Quaile, Dillon McKenna, Minomi Subapanditha, Tomáš Tokár, Muhammad Vaseem Shaikh, Kui Zhai, Shawn C. Chafe, Patrick T. Gunning, J. Rafael Montenegro-Burke, Chitra Venugopal, Jakob Magolan, Sheila K. Singh

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCell Reports Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensJuravinski Cancer CentreUniversity Health NetworkUniversity of TorontoMcMaster UniversityDiscovery CentreMcMaster University Medical Centre
Organismes subventionnairesScience and Engineering Research CouncilCanadian Cancer Society Research InstituteMitacsCanada Foundation for InnovationOntario Institute for Cancer ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcMaster University
Mots-clésInterceptionGTP'Vulnerability (computing)NeuroscienceBiologyComputational biologyComputer scienceEcologyBiochemistryComputer securityEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Patients with brain metastases (BM) face a 90% mortality rate within one year of diagnosis and the current standard of care is palliative. Targeting BM-initiating cells (BMICs) is a feasible strategy to treat BM, but druggable targets are limited. Here, we apply Connectivity Map analysis to lung-, breast-, and melanoma-pre-metastatic BMIC gene expression signatures and identify inosine monophosphate dehydrogenase (IMPDH), the rate-limiting enzyme in the de novo GTP synthesis pathway, as a target for BM. We show that pharmacological and genetic perturbation of IMPDH attenuates BMIC proliferation in vitro and the formation of BM in vivo. Metabolomic analyses and CRISPR knockout studies confirm that de novo GTP synthesis is a potent metabolic vulnerability in BM. Overall, our work employs a phenotype-guided therapeutic strategy to uncover IMPDH as a relevant target for attenuating BM outgrowth, which may provide an alternative treatment strategy for patients who are otherwise limited to palliation. • Connectivity Map analysis performed on a pre-metastatic transcriptomic signature • Drug discovery via phenotypic screen identifies mycophenolic acid • Targeting IMPDH with mycophenolic acid slows brain metastasis formation • IMPDH is a potential biomarker for at-risk patients with lung cancer Kieliszek et al. use a phenotypic drug discovery approach to identify IMPDH as a targetable metabolic vulnerability in brain metastasis. Medicinal chemistry efforts suggest that prioritizing the BBB permeability of IMPDH inhibitors enhances their preclinical efficacy. Targeting IMPDH represents an avenue to block brain metastasis formation in at-risk patients with cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,557
Score d'incertitude au seuil0,364

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle