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Enregistrement W4403152269 · doi:10.1210/jendso/bvae163.176

12540 Epigenetic Subtyping Of Adrenocortical Carcinoma In Archival Material And Implications For Disease Evolution

2024· article· en· W4403152269 sur OpenAlexaff
Devi Mohan, Antônio Marcondes Lerário, Madson Q. Almeida, Berenice B. Mendonça, Antuono Latronico, Maria Candida Barisson Villares Fragoso, Gary D. Hammer

Notice bibliographique

RevueJournal of the Endocrine Society · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensWiLAN (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubtypingAdrenocortical carcinomaEpigeneticsDiseaseBiologyComputational biologyMedicinePathologyGeneticsComputer scienceProgramming languageGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Disclosure: D. Mohan: None. A.M. Lerario: None. M.Q. Almeida: None. B.B. Mendonca: None. A. Latronico: None. M.C. Fragoso: None. G.D. Hammer: None. Adrenocortical carcinoma (ACC) is a rare cancer of the adrenal cortex, to date cured only by surgery. Pangenomic studies demonstrate that ACC is comprised of three molecular subtypes with distinct clinical outcomes. CIMP-high ACC, the most aggressive molecular subtype, is defined by abnormal epigenetic patterning including inappropriate DNA methylation. CIMP-high status of the primary tumor accounts for 30% of all ACC, but 70% of metastatic relapses. It remains unclear if ACC transitions molecular subtypes, e.g. acquires CIMP-high status, during metastatic dissemination. We and others have demonstrated that G0S2 methylation is a sensitive and specific single-locus biomarker capturing CIMP-high ACC. However, our prior studies utilized frozen tissues, often only available at specialized centers. Here, we measured G0S2 methylation in an expanded cohort of n=73 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) primary, recurrent, and metastatic ACC samples. We show that G0S2 methylation status is stable in archival FFPE material, concordant with measurement in frozen specimen (Pearson r=0.94, n=28). We identify that, within individual patients, the G0S2 methylation status of the primary is often preserved in the metastasis or recurrence. These data suggest that ACC subtype switching is not required for metastatic evolution. In cases of advanced ACC with accessible lesions amenable to biopsy, epigenetic subtypes can be diagnosed prior to oncologic resection, enabling subtype-specific therapeutic interventions in the neoadjuvant setting. Presentation: 6/1/2024

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,152

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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