12540 Epigenetic Subtyping Of Adrenocortical Carcinoma In Archival Material And Implications For Disease Evolution
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Disclosure: D. Mohan: None. A.M. Lerario: None. M.Q. Almeida: None. B.B. Mendonca: None. A. Latronico: None. M.C. Fragoso: None. G.D. Hammer: None. Adrenocortical carcinoma (ACC) is a rare cancer of the adrenal cortex, to date cured only by surgery. Pangenomic studies demonstrate that ACC is comprised of three molecular subtypes with distinct clinical outcomes. CIMP-high ACC, the most aggressive molecular subtype, is defined by abnormal epigenetic patterning including inappropriate DNA methylation. CIMP-high status of the primary tumor accounts for 30% of all ACC, but 70% of metastatic relapses. It remains unclear if ACC transitions molecular subtypes, e.g. acquires CIMP-high status, during metastatic dissemination. We and others have demonstrated that G0S2 methylation is a sensitive and specific single-locus biomarker capturing CIMP-high ACC. However, our prior studies utilized frozen tissues, often only available at specialized centers. Here, we measured G0S2 methylation in an expanded cohort of n=73 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) primary, recurrent, and metastatic ACC samples. We show that G0S2 methylation status is stable in archival FFPE material, concordant with measurement in frozen specimen (Pearson r=0.94, n=28). We identify that, within individual patients, the G0S2 methylation status of the primary is often preserved in the metastasis or recurrence. These data suggest that ACC subtype switching is not required for metastatic evolution. In cases of advanced ACC with accessible lesions amenable to biopsy, epigenetic subtypes can be diagnosed prior to oncologic resection, enabling subtype-specific therapeutic interventions in the neoadjuvant setting. Presentation: 6/1/2024
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».