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Enregistrement W4403175542 · doi:10.1093/brain/awae314

Data-driven neuroanatomical subtypes of primary progressive aphasia

2024· article· en· W4403175542 sur OpenAlexfundno aff
Beatrice Taylor, Martina Bocchetta, Cameron Shand, Emily Todd, Anthipa Chokesuwattanaskul, Sebastian J. Crutch, Jason D. Warren, Jonathan D. Rohrer, Chris JD Hardy, Neil P. Oxtoby

Notice bibliographique

RevueBrain · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology of Language and Bilingualism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMedical Research CouncilNational Institute on AgingRoyal National Institute for Deaf PeopleAlzheimer’s SocietyAlzheimer’s Research UKUniversity College LondonAlzheimer SocietyNational Center for Advancing Translational SciencesAlzheimer's SocietyBrain Research UK
Mots-clésPrimary progressive aphasiaAphasiaNeurosciencePsychologyMedicineAudiologyPathologyDiseaseDementia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The primary progressive aphasias are rare, language-led dementias, with three main variants: semantic, non-fluent/agrammatic and logopenic. Although the semantic variant has a clear neuroanatomical profile, the non-fluent/agrammatic and logopenic variants are difficult to discriminate from neuroimaging. Previous phenotype-driven studies have characterized neuroanatomical profiles of each variant on MRI. In this work, we used a machine learning algorithm known as SuStaIn to discover data-driven neuroanatomical 'subtype' progression profiles and performed an in-depth subtype-phenotype analysis to characterize the heterogeneity of primary progressive aphasia. Our study included 270 participants with primary progressive aphasia seen for research in the UCL Queen Square Institute of Neurology Dementia Research Centre, with follow-up scans available for 137 participants. This dataset included individuals diagnosed with all three main variants (semantic, n = 94; non-fluent/agrammatic, n = 109; logopenic, n = 51) and individuals with unspecified primary progressive aphasia (n = 16). A dataset of 66 patients (semantic, n = 37; non-fluent/agrammatic, n = 29) from the ARTFL LEFFTDS Longitudinal Frontotemporal Lobar Degeneration (ALLFTD) Research Study was used to validate our results. MRI scans were segmented, and SuStaIn was used on 19 regions of interest to identify neuroanatomical profiles independent of the diagnosis. We assessed the assignment of subtypes and stages, in addition to their longitudinal consistency. We discovered four neuroanatomical subtypes of primary progressive aphasia, labelled S1 (left temporal), S2 (insula), S3 (temporoparietal) and S4 (frontoparietal), exhibiting robustness to statistical scrutiny. S1 was correlated strongly with the semantic variant, whereas S2, S3 and S4 showed mixed associations with the logopenic and non-fluent/agrammatic variants. Notably, S3 displayed a neuroanatomical signature akin to a logopenic-only signature, yet a significant proportion of logopenic cases were allocated to S2. The non-fluent/agrammatic variant demonstrated diverse associations with S2, S3 and S4. No clear relationship emerged between any of the neuroanatomical subtypes and the unspecified cases. At first follow-up, subtype assignment was stable for 84% of patients, and stage assignment was stable for 91.9% of patients. We partially validated our findings in the ALLFTD dataset, finding comparable qualitative patterns. Our study, leveraging machine learning on a large primary progressive aphasia dataset, delineated four distinct neuroanatomical patterns. Our findings suggest that separable spatiotemporal neuroanatomical phenotypes do exist within the primary progressive aphasia spectrum, but that these are noisy, particularly for the non-fluent/agrammatic non-fluent/agrammatic and logopenic variants. Furthermore, these phenotypes do not always conform to standard formulations of clinico-anatomical correlation. Understanding the multifaceted profiles of the disease, encompassing neuroanatomical, molecular, clinical and cognitive dimensions, has potential implications for clinical decision support.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,274
Score d'incertitude au seuil0,331

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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