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Enregistrement W4403211103 · doi:10.1109/iri62200.2024.00032

Enhancing Choroidal Nevi Segmentation in Fundus Images Using YOLO

2024· article· en· W4403211103 sur OpenAlexaff
Mehregan Biglarbeiki, Roberto Souza, Emad A. Mohammed, Ezekiel Weis, Carol L. Shields, S Ferenczy, Behrouz H. Far, Trafford Crump

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Imaging and Analysis
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityUniversity of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFundus (uterus)Computer scienceArtificial intelligenceSegmentationComputer visionImage segmentationOphthalmologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Choroidal nevus often appears as a darkly pigmented, benign ocular lesion, which may progress to malignant forms, such as choroidal melanoma. Prompt and precise diagnosis of choroidal melanoma cannot be overstated as untreated cases can lead to vision loss and even life-threatening metastasis, under-scoring the importance of regular screening of the eye. However, this procedure is performed manually, which can be time-consuming and prone to human errors. Recent advancements in deep learning show potential for detecting eye diseases, including choroidal nevi. However, these models require extensive labelled data, which can be difficult to acquire due to the associated labelling costs. In this paper, we utilize two approaches to tackle these challenges. Firstly, we leverage a pre-trained YOLOv8 segmentation model and train it on both patches and full-size high-resolution colour fundus images. This strategy effectively expands the dataset size and allows the model to focus on the fine details of lesions within individual patches while understanding the general shape of the lesions by analyzing the entire image. Secondly, we use data augmentation to further expand the dataset size and tackle the class imbalance problem. Additionally, through the utilization of post-processing techniques, we enhance the predicted masks by addressing any potential flaws. This approach resulted in a 0.833 Dice Coefficient Score and a 0.714 Intersection Over Union (IOU) in our initial dataset and a Dice score of 0.764 and IOU of 0.618 on our second test set collected from a different site. In both datasets, this approach surpassed the models trained exclusively on full-size images.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil0,297

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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