Influenza-Like Illness in Lesotho From July 2020 to July 2021: Population-Based Participatory Surveillance Results
Notice bibliographique
Résumé
Background: Participatory surveillance involves at-risk populations reporting their symptoms using technology. In Lesotho, a landlocked country of 2 million people in Southern Africa, laboratory and case-based COVID-19 surveillance systems were complemented by a participatory surveillance system called "LeCellPHIA" (Lesotho Cell Phone Population-Based HIV Impact Assessment Survey). Objective: This report describes the person, place, and time characteristics of influenza-like illness (ILI) in Lesotho from July 15, 2020, to July 15, 2021, and reports the risk ratio of ILI by key demographic variables. Methods: LeCellPHIA employed interviewers to call participants weekly to inquire about ILI. The average weekly incidence rate for the year-long period was created using a Quasi-Poisson model, which accounted for overdispersion. To identify factors associated with an increased risk of ILI, we conducted a weekly data analysis by fitting a multilevel Poisson regression model, which accounted for 3 levels of clustering. Results: The overall response rate for the year of data collection was 75%, which resulted in 122,985 weekly reports from 1776 participants. ILI trends from LeCellPHIA mirrored COVID-19 testing data trends, with an epidemic peak in mid to late January 2021. Overall, any ILI symptoms (eg, fever, dry cough, and shortness of breath) were reported at an average weekly rate of 879 per 100,000 (95% CI 782-988) persons at risk. Compared to persons in the youngest age group (15-19 years), all older age groups had an elevated risk of ILI, with the highest risk of ILI in the oldest age group (≥60 years; risk ratio 2.6, 95% CI 1.7-3.8). Weekly data were shared in near real time with the National COVID-19 Secretariat and other stakeholders to monitor ILI trends, identify and respond to increases in reports of ILI, and inform policies and practices designed to reduce COVID-19 transmission in Lesotho. Conclusions: LeCellPHIA, an innovative and cost-effective system, could be replicated in countries where cell phone ownership is high but internet use is not yet high enough for a web- or app-based surveilance system.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».