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Enregistrement W4403223826 · doi:10.1139/cjz-2024-0012

Geographic, ecological, and temporal patterns of seabird mortality during the 2022 HPAI H5N1 outbreak on the island of Newfoundland

2024· article· en· W4403223826 sur OpenAlexafffundvenueabout
Gretchen McPhail, Sydney M. Collins, Tori V. Burt, Noah G. Careen, Parker Doiron, Stephanie Avery‐Gomm, Tatsiana Barychka, Matthew D. English, Jolene A. Giacinti, Megan Jones, Jennifer F. Provencher, Catherine Soos, Christopher R. E. Ward, Steven Duffy, Sabina I. Wilhelm, Jordan Wight, Ishraq Rahman, Kathryn E. Hargan, Andrew S. Lang, William A. Montevecchi

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Zoology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaEnvironment and Climate Change CanadaUniversity of Prince Edward IslandMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesEnvironment and Climate Change CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMemorial University of NewfoundlandUniversities Space Research Association
Mots-clésSeabirdBiologyOutbreakEcologyInfluenza A virus subtype H5N1ZoologyPredation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Highly pathogenic avian influenza (HPAI) H5N1 caused mass mortality of wildlife across the North Atlantic in 2022. Following European outbreaks, the first North American case was detected on the island of Newfoundland, Canada in November 2021, before spreading throughout North America. During the following summer, Newfoundland and surrounding islands (NFLD) experienced one of the most significant mortalities in Canadian provinces, with seabirds being the most affected taxa. From surveys and citizen reports, we estimate that 13 517 mortalities that can be attributed to HPAI occurred in NFLD from April to September 2022. Most estimated mortalities were among Northern Gannets ( Morus bassanus (Linnaeus, 1758)) (6596), Common Murres ( Uria aalge (Pontoppidan, 1763)) (5992), Atlantic Puffins ( Fratercula arctica (Linnaeus, 1758)) (282), and Black-legged Kittiwakes ( Rissa tridactyla (Linnaeus, 1758)) (217). Mortality reports moved from west to east along the southern, then eastern NFLD coast, and peaked in July and August. We formulated exploratory hypotheses regarding traits that could contribute to infection and mortality. Species differences in mortality most strongly associated with inter-nest distance, breeding phenology, and at-sea overlap with allospecifics from other colonies. Unprecedented seabird mortality and ongoing transmission within the circulating avian influenza viruses highlight the need for continued monitoring and development of conservation strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,672
Score d'incertitude au seuil0,652

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2024
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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