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Enregistrement W4403242072 · doi:10.1515/chem-2024-0085

Integrative <i>in silico</i> evaluation of the antiviral potential of terpenoids and its metal complexes derived from <i>Homalomena aromatica</i> based on main protease of SARS-CoV-2

2024· article· en· W4403242072 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueOpen Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesDeanship of Scientific Research, King Saud UniversityKing Saud University
Mots-clésIn silicoSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)TerpenoidVirologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)2019-20 coronavirus outbreakComputational biologyBiologyStereochemistryChemistryMedicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Substantial research is currently conducted focusing on the development of promising antiviral drugs employing in silico screening and drug repurposing strategies against SARS-CoV-2. The current study aims at identifying lead molecules targeting SARS-CoV-2 by the application of in silico and molecular dynamics (MD) approaches from phytoconstituents present in Homalomena aromatica . The main protease (M pro ) enzyme of SARS-CoV-2 is taken as the target protein to perform the docking analysis of 71 molecules reported from H. aromatica by the application of different modules of Discovery Studio 2018. Five molecules were taken as prospective leads namely dihydrocuminaldehyde, p -cymen-8-ol, cuminaldehyde, p -cymene, and cuminol. In the absence of known inhibitors, a comparative study was performed with the compounds reported in the literature and potent terpenoid–metal complexes were taken into account based on known efficacy as anti-viral molecules. After performing the docking studies with Mpro enzyme of SARS-CoV-2, it was observed that the –CDocker Energy of cuminaldehyde thiosemicarbazone was 29.152, indicating a significant affinity toward Mpro. The same was also supported by the MD study. Taken together, our results provided in silico evidence that secondary metabolites derived from H. aromatica could be employed as potent antiviral agents targeting SARS-CoV-2. Our findings warrant further validation of their in vitro and in vivo efficacies prior to their development into bona fide therapeutic agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,419
Score d'incertitude au seuil0,460

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle