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Enregistrement W4403265949 · doi:10.1016/j.biopsych.2024.07.025

Genome-Wide Association Study Meta-Analysis of 9619 Cases With Tic Disorders

2024· review· en· W4403265949 sur OpenAlex
Nora I. Strom, Matthew Halvorsen, Jakob Grove, Bergrún Ásbjörnsdóttir, Pétur Lúðvígsson, Ólafur Thorarensen, Elles de Schipper, Julia Bäckmann, Per E. Andrén, Chao Tian, Dongmei Yu, Jae Hoon Sul, Fotis Tsetsos, Muhammad Sulaman Nawaz, Alden Y. Huang, Ivette Zelaya, Cornelia Illmann, Lisa Osiecki, Sabrina M. Darrow, Matthew E. Hirschtritt, Erica Greenberg, Kirsten Müller‐Vahl, Manfred Stuhrmann, Yves Dion, Guy A. Rouleau, H.N. Aschauer, M. Stamenković, Monika Schlögelhofer, Paul Sandor, Cathy L. Barr, Marco A. Grados, Harvey S. Singer, Markus M. Nöthen, Johannes Hebebrand, Anke Hinney, Robert A. King, Thomas V. Fernandez, Csaba Barta, Zsanett Tárnok, Peter Nagy, Christel Depienne, Yulia Worbe, Andreas Hartmann, Cathy L. Budman, Renata Rizzo, Gholson J. Lyon, William M. McMahon, James R. Batterson, Daniëlle C. Cath, Irene A. Malaty, Michael S. Okun, Cheston M. Berlin, Douglas W. Woods, Paul C. Lee, Joseph Jankovic, Mary M. Robertson, Donald L. Gilbert, Lawrence W. Brown, Barbara Coffey, Andrea Dietrich, Pieter J. Hoekstra, Samuel Kuperman, Samuel H. Zinner, Evald Sæmundsen, Gil Atzmon, Nir Barzilai, Michael Wagner, Rainald Moessner, Roel A. Ophoff, Carlos N. Pato, Michele T. Pato, James A. Knowles, Joshua L. Roffman, Jordan W. Smoller, Randy L. Buckner, Jeremy A. Willsey, Jay A. Tischfield, Gary A. Heiman, Hreinn Stefánsson, Kāri Stefánsson, Daniëlle Posthuma, Nancy J. Cox, David L. Pauls, Nelson B. Freimer, Benjamin M. Neale, Lea K. Davis, Peristera Paschou, Giovanni Coppola, Carol A. Mathews, Jeremiah M. Scharf, Michelle Agee, Adam Auton, Robert K. Bell, Katarzyna Bryc, Sarah L. Elson, Pierre Fontanillas, Nicholas A. Furlotte, Barry Hicks, Karen E. Huber, Ethan M. Jewett, Yunxuan Jiang, Aaron Kleinman, Keng‐Han Lin, Nadia K. Litterman, Jey C. McCreight, Matthew H. McIntyre, Kimberly F. McManus, Joanna L. Mountain, Elizabeth S. Noblin, Carrie A. M. Northover, Steven J. Pitts, G. David Poznik, J. Fah Sathirapongsasuti, Janie F. Shelton, Suyash Shringarpure, Joyce Y. Tung, Vladimir Vacic, Xin Wang, Thomas D. Als, Judith Becker Nissen, Sandra Meier, Jonas Bybjerg‐Grauholm, David M. Hougaard, Thomas Werge, Anders D. Børglum, David A. Hinds, Christian Rück, David Mataix-Cols, Kari Stefansson, James J. Crowley, Manuel Mattheisen

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiological Psychiatry · 2024
Typereview
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueObsessive-Compulsive Spectrum Disorders
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesHORIZON EUROPE Framework ProgrammeStockholms Läns LandstingGillings School of Public HealthForskningsrådet om Hälsa, Arbetsliv och VälfärdEuropean CommissionAarhus UniversitetNovo NordiskCenter for Innovative MedicineNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SNational Institute of Mental HealthVetenskapsrådetLundbeckfonden
Mots-clésMeta-analysisGenome-wide association studyAssociation (psychology)Genetic associationGeneticsMedicineBiologyComputational biologyInternal medicinePsychologySingle-nucleotide polymorphismGeneGenotypePsychotherapist

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Despite the significant personal and societal burden of tic disorders (TDs), treatment outcomes remain modest, necessitating a deeper understanding of their etiology. Family history is the biggest known risk factor, and identifying risk genes could accelerate progress in the field. METHODS: Expanding upon previous sample size limitations, we added 4800 new TD cases and 971,560 controls and conducted a genome-wide association study (GWAS) meta-analysis with 9619 cases and 981,048 controls of European ancestry. We attempted to replicate the results in an independent deCODE genetics GWAS (885 TD cases and 310,367 controls). To characterize GWAS findings, we conducted several post-GWAS gene-based and enrichment analyses. RESULTS: ) within MCHR2-AS1 was identified, although it was not replicated. Post-GWAS analyses revealed a 13.8% single nucleotide polymorphism heritability and 3 significant genes: BCL11B, NDFIP2, and RBM26. Common variant risk for TD was enriched within genes preferentially expressed in the cortico-striato-thalamo-cortical circuit (including the putamen, caudate, nucleus accumbens, and Brodmann area 9) and 5 brain cell types (excitatory and inhibitory telencephalon neurons, inhibitory diencephalon and mesencephalon neurons, and hindbrain and medium spiny neurons). TD polygenic risk was enriched within loss-of-function intolerant genes (p = .0017) and high-confidence neurodevelopmental disorder genes (p = .0108). Of 112 genetic correlations, 43 were statistically significant, showing high positive correlations with most psychiatric disorders. Of the 2 single nucleotide polymorphisms previously associated with TDs, one (rs2453763) replicated in an independent subsample of our GWAS (p = .00018). CONCLUSIONS: This GWAS was still underpowered to identify high-confidence, replicable loci, but the results suggest imminent discovery of common genetic variants for TDs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,153
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,005
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle