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Enregistrement W4403284274 · doi:10.1371/journal.pone.0311857

Sex and organ specific proteomic responses to vitamin C deficiency in the brain, heart, liver, and spleen of Gulo-/- mice

2024· article· en· W4403284274 sur OpenAlexafffund
Lucie Aumailley, Michel Lebel

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueVitamin C and Antioxidants Research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésFerritinSpleenBiologyWestern blotInternal medicineVitaminEndocrinologyVitamin CVitamin D and neurologyBiochemistryImmunologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent advances in mass spectrometry have indicated that the water-soluble antioxidant vitamin C differentially modulates the abundance of various proteins in the hepatic tissue of female and male mice. In this study, we performed LC-MS/MS to identify and quantify proteins that correlate with serum vitamin C concentrations in the whole brain, heart, liver, and spleen tissues in mice deficient for the enzyme L-Gulonolactone oxidase required for vitamin C synthesis in mammals. This work shows for the first time that various biological processes affected by a vitamin C deficiency are not only sex specific dependent but also tissue specific dependent even though many proteins have been identified and quantified in more than three organs. For example, the abundance of several complex III subunits of the mitochondrial electron transport chain correlated positively with the levels of serum vitamin C only in the liver and not in the other tissues examined in this study even though such proteins were identified in all the organs analyzed. Western blot analyses on the Uqcrc1 and Uqcrfs1 complex III subunits validated the mass spectrometry results. Interestingly, the ferritin subunits represented the few quantified protein complexes that correlated positively with serum vitamin C in all the organs examined. Concomitantly, serum ferritin light chain 1 was inversely correlated with vitamin C levels in the serum. Thus, our study provides an initial comprehensive atlas of proteins significantly correlating with vitamin C in four organs in mice that will be a useful resource to the scientific community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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