Arctic tundra soil depth, more than seasonality, determines active layer bacterial community variation down to the permafrost transition
Notice bibliographique
Résumé
Enhanced microbial decomposition of the Arctic’s vast soil carbon pool due to climate warming could result in globally significant CO 2 /CH 4 emissions. Our understanding of tundra soil microbial communities is generally based on studies of either the top surface or the deep frozen permafrost. In contrast, there has been relatively little exploration of bacterial communities and soil biogeochemistry through entire soil depth profiles to the permafrost, and none that has specifically incorporated temporal dynamics with depth as the summer thaw proceeds. Here we report bacterial community composition in 10-cm increments from the surface to the permafrost from late winter through to autumn, at a mesic low Arctic tundra site. Bacterial community composition and phylogenetic diversity varied substantially with soil depth and much less among sampling times. Correlation analysis indicated that the surface organic, subsoil mineral, and permafrost transition soil layers each had distinct community interaction networks. Acidobacteriota- affiliated taxa dominated surface communities but declined significantly with soil depth and increasing pH, while Bacteroidetes taxa relative abundances were also associated with pH, and were largest in the carbon-restricted permafrost transition layer. Thus, patterns in community assembly were primarily associated with depth and correlated with edaphic factors, with relatively little impact of the seasonal changes between frozen and thawed assemblages within each sampling depth interval. Nevertheless, total microbial biomass within each depth interval generally declined during the seasonal transition from frozen to thawed state. Finally, our data indicate that soil pH, which is known to govern tundra microbial community composition horizontally across the surface organic layer at multiple spatial scales, is also an important determinant of vertical differences in bacterial community composition from the surface down to the permafrost. • Soil depth has a greater impact on bacterial community composition than season. • Organic, mineral, and permafrost transition layer soil communities are distinct. • Seasonal thaw generally leads to microbial biomass declines within most soil depths.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».