CDK-dependent phosphorylation regulates PNKP function in DNA replication
Notice bibliographique
Résumé
Okazaki fragment maturation (OFM) stands as a pivotal DNA metabolic process, crucial for genome integrity and cell viability. Dysregulation of OFM leads to DNA single-strand breaks-accumulation, which is linked to various human diseases such as cancer and neurodegenerative disorders. Recent studies have implicated LIG3-XRCC1 acting in an alternative OFM pathway to the canonical FEN1-LIG1 pathway. Here, we reveal that polynucleotide kinase-phosphatase (PNKP) is another key participant in DNA replication, akin to LIG3-XRCC1. Through functional experiments, we demonstrate PNKP's enrichment at DNA replication forks and its association with PCNA, indicating its involvement in DNA replication processes. Cellular depletion of PNKP mirrors defects observed in OFM-related proteins, highlighting its significance in replication fork dynamics. Additionally, we identify PNKP as a substrate for cyclin-dependent kinase 1 and 2 (CDK1/2), which phosphorylates PNKP at multiple residues. Mutation analysis of these phosphorylation sites underscores the importance of CDK-mediated PNKP phosphorylation in DNA replication. Our findings collectively indicate a novel role for PNKP in facilitating Okazaki fragments joining, thus shedding light on its contribution to genome stability maintenance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».