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Enregistrement W4403312853 · doi:10.3389/fonc.2024.1466658

Long-term exposure to BAY2416964 reduces proliferation, migration and recapitulates transcriptional changes induced by AHR loss in PyMT-induced mammary tumor cells

2024· article· en· W4403312853 sur OpenAlexaff
Ninni Elise Olafsen, Siddhartha Das, Chiara Gorrini, Jason Matthews

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Oncology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueTryptophan and brain disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNorges Forskningsråd
Mots-clésAryl hydrocarbon receptorCarcinogenesisCell growthCancer researchBiologyKnockout mouseCell cultureChemistryTranscription factorReceptorCancerGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aryl hydrocarbon receptor (AHR) is a ligand activated transcription factor which in certain cancer types drives pro-survival processes that facilitate tumorigenesis, malignant cell migration, invasion, and metastasis. Much of AHR’s pro-tumorigenic action is due to its activation by the oncometabolite, kynurenine. Because of this AHR antagonists are being actively investigated as new anti-tumor therapy. In this study we compared the effects of treatment with the AHR antagonists, BAY2416964 and GNF351, to that of AHR knockout in PyMT murine mammary cancer cells. BAY2416964 and GNF351 effectively inhibited kynurenine-dependent increases in Cyp1a1 and Cyp1b1 mRNA levels. CRISPR/Cas9-generated PyMT Ahr KO cells exhibited reduced cell proliferation compared with controls, but treatment with 1 μM BAY2416964 for 96 h had no effect on the proliferation of wildtype cells. To further examine the differences between AHR knockout and short term BAY2416964, we generated long-term BAY2416964 (LT-BAY) cells by exposing wildtype cells to 1 μM BAY2416964 for at least 6 weeks. Similar to Ahr KO cells, LT-BAY cells exhibited reduced cell proliferation and migration compared with wildtype cells. No differentially expressed genes (DEGs) were identified in wildtype cells exposed to 1 μM BAY2416964 for 24 h; however, 46.4% of DEGs overlapped between Ahr KO and LT-BAY cells including gene regulated cell proliferation. Our data reveal long-term pharmacological inhibition of AHR by BAY2416964 closely resembles AHR loss in a mouse model of breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil0,907

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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