Serratia marcescens Burden in a Neonatal Intensive Care Unit: Colonization Rate, Clinical Infections and Strain Relatedness
Notice bibliographique
Résumé
Background: Serratia marcescens (S. marcescens) is an environmentally associated organism known for causing healthcare associated infections and outbreaks in neonatal intensive care units (NICUs). The colonization or infection rates in NICU settings remain uncertain. This study aims to evaluate the rate of baseline colonization and clinical infection and relatedness of S. marcescens isolates. Methods: Prospective surveillance of rectal colonization and clinical infection of S. marcescens was conducted on patients admitted to the NICU at Mount Sinai Hospital in Toronto, Ontario, from March 1, 2023, to September 30, 2023. The NICU is a 57 bed unit with all private rooms. Monthly point prevalence assessments by rectal screening were performed, alongside active surveillance for clinical infections associated with S. marcesens. Isolates from screening or clinical samples underwent assessment for relatedness using pulse field gel electrophoresis (PFGE). Results: Over the 7 month study period, 12 different patients (5.4%) were colonized/infected with S. marcescens. Among these, 10 patients (4.5%) were identified through rectal screening (316 rectal swabs were collected from 224 patients) and two patients (0.9%) exhibited positive clinical specimens (urine and endotracheal aspirate) in association with pyelonephritis and ventilator-associated pneumonia, respectively. Of the two clinical cases, one case showed a negative preceding rectal swab and the other detected through a clinical sample before the point prevalence date. The age at which a positive S. marcescens swab or positive clinical specimen was identified ranged from 4 to 66 days (median=18 days, IQR 5-38.8) (Figure 1). Sixty seven infants had repeated screening. Three out of 67 (4.5%) were colonized with S. marcescens, the timing and sequence of positive and negative testing are presented in Figure 2. Females demonstrated a higher positivity rate compared to males [9.1% (9/99) vs 2.4% (3/125), p=0.04, respectively]. PFGE analysis of all 12 (100%) isolates revealed a polyclonal pattern. Most cases were detected from March to May in 9/12 cases (75%). Ten different strains were identified. Notably, two strains demonstrated clusters of two cases each, one during March and the other during May (Figure 3). No mortality was reported among the cases. Conclusions: The study highlights the polyclonal nature of S. marcesens and raises questions about the utility of point prevalence in anticipating clinical cases or patient-to-patient transmission, especially in patients with clinical infection where there were no preceding positive screening tests.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».