Longitudinal Follow Up of Patients Colonized with Clostridioides difficile: a Retrospective Cohort Study
Notice bibliographique
Résumé
Background: Patients colonized with Clostridioides difficile are at risk of transmitting C. difficile to other patients, and of developing C. difficile infection (CDI). Known risk factors for carriage include previous hospitalization, gastric acid suppression and previous CDI. Data regarding duration of carriage and its predictors are lacking but could be useful to better understand the natural evolution of carriage and better estimate the likelihood of transmission or progression to CDI. Methods: We performed a retrospective cohort study of C. difficile colonized patients with > = 1 admission to a tertiary academic institution between November 2013 and January 2017. Colonization status was determined upon hospital admission by detection of TcdB gene by polymerase chain reaction on a rectal screening swab, as part of a systematic screening program. Overall duration of carriage and predictors of prolonged carriage were explored using Kaplan-Meier methods and Cox regression. Results: There were 134 patients, who after having a positive initial screening test (and therefore identified as colonized with C. difficile), had subsequent testing. The median age was 77 years (IQR, 66 to 85), and 53.6% of the patients were female. After hospital discharge, 26 (19.4%) colonized patients progressed to CDI. Mean duration of follow up was 269 days, with a median of 179 days. Median duration of carriage was 211 days, (95% confidence interval (CI) [157, 264]). Predictors associated with decreased duration of C. difficile colonization included younger age (HR per unit decrease (year), 1.013; 95% CI, 1.025 to 1.001; p=0.03), and receipt of antibiotics in the 3 months prior to first admission (mean days to clearance of patients with and without recent antibiotic use, 252 days vs 372 days, respectively; HR, 1.55; 95% CI, 1.01 to 2.36; p < 0 .04). By contrast, the presence of comorbidities (e.g. heart failure, diabetes, cancer, and chronic kidney disease), the use of proton-pump inhibitors (PPIs), the receipt of antibiotics during the first admission, and the duration of first hospitalization were not associated with significant differences in duration of carriage. Conclusion: This study is the largest cohort of C. difficile carriers with longitudinal follow up of their colonization status. It highlights the extended duration of carrier status especially in older patients and identifies predictors of prolonged carriage. Further studies are needed to understand the underlying relationship with the predictors identified in this study.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».