MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4403378365 · doi:10.1016/j.clinpr.2024.100393

Somatic STAT3 Gain-of-Function (GOF) syndrome underlying susceptibility to Parvovirus B19, Pseudomonas aeruginosa, and Histoplasma capsulatum infections

2024· article· en· W4403378365 sur OpenAlexafffund
Cedric Julien, Stephane Bernier, Denis Cournoyer, Yizhe Sun, Anna Perez, Joy Agbonze, Isabelle Angers, Lucie Roussel, Gizelle Popradi, Donald C. Vinh

Notice bibliographique

RevueClinical Infection in Practice · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - Santé
Mots-clésParvovirusHistoplasma capsulatumPseudomonas aeruginosaMicrobiologyBiologyVirologyHistoplasmosisImmunologyGeneticsVirusBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

• Severe infections in healthy hosts may signal an underlying immune deficiency. • Inborn errors of immunity (IEI) are monogenic defects, often germline mutations. • IEI can also arise from autoantibodies or somatic mutations. • Somatic STAT3 gain-of-function (GOF) mutations underlie autoimmunity and cancers. • Somatic STAT3 GOF mutation can present as immunodeficiency with severe infections. Infections in overtly immunocompromised persons (e.g. those living with advanced HIV, receiving malignancy-targeting chemotherapy, or recipients of transplants), may present with severe disease. In the absence of overt immunosuppression, unexplained severe disease due to prevalent microbes may reflect an underlying “inborn error of immunity” (IEI). IEI are monogenic penetrant defects of immunity: Classically, the genetic mutation is germline, that is, derived from germ cells, vertically transmitted to offspring in Mendelian fashion (autosomal dominant, autosomal recessive, or X-linked), and present in all cells of the affected individual. IEI may also be caused by naturally-occurring autoantibodies directed to immunologic components (such as cytokines) ( Casanova et al., 2024 ) or by somatic mutations ( Aluri and Cooper, 2023 ). Somatic mutations occur when a deleterious genetic variant occurs in the post-zygotic stage of development and can affect any body cell, other than germ cells; they are well-known causes of solid and hematologic malignancies. Somatic IEI syndromes are emerging, typically associated with lymphoproliferative diseases or autoinflammatory disorders. We report the case of a young woman with unexplained severe infections in whom a somatic gain-of-function (GOF) mutation in Signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3) was found.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,348
Score d'incertitude au seuil0,982

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueClinical Infection in PracticeMême sujetImmunodeficiency and Autoimmune DisordersTravaux en français237 207