Genome engineering of the major goat pathogen Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae as a first step towards the rational design of improved vaccines
Notice bibliographique
Résumé
Background- Mycoplasma capricolum subspecies capripneumoniae (Mccp) is the causative agent of contagious caprine pleuropneumonia (CCPP), a disease listed by the world organization for animal health (WOAH) threatening goat production in Africa and Asia. Although a few commercial inactivated vaccines are available, they do not comply with WOAH standards and their efficacy is questioned. One of the limiting factors to comprehend the molecular pathogenesis of CCPP and develop improved vaccines has been the lack of tools for Mccp genome engineering. Results- In this study, synthetic biology techniques, recently developed for closely related mycoplasmas, were adapted to Mccp. CReasPy-cloning was used to simultaneously clone and engineer the Mccp genome in yeast, prior to whole genome transplantation into M. capricolum subsp. capricolum recipient cells. This approach was used to knock-out an S41 serine protease gene identified as a potential virulence factor, leading to the generation of the first site-specific Mccp mutants. This approach was further extended to two other field strains of Mccp using CReasPy-Fusion, a method that allows to clone and edit bacterial genomes in yeast through cell-to-cell contact. Furthermore, the Cre-lox recombination system was applied to remove all DNA sequences added during genome engineering. Finally, the resulting unmarked S41 serine protease mutants were validated by genome sequencing and their noncaseinolytic phenotype was confirmed by casein digestion assay. Conclusion- Synthetic biology tools were successfully implemented in Mccp. This innovation allows constructing targeted Mccp mutants at ease, which will be of great help to decipher Mccp pathogenicity determinants and develop novel vaccines.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».