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Enregistrement W4403448409 · doi:10.1073/pnas.2402759121

Live-cell imaging under centrifugation characterized the cellular force for nuclear centration in the <i>Caenorhabditis elegans</i> embryo

2024· article· en· W4403448409 sur OpenAlexfundno aff
Makoto Goda, Michael Shribak, Zenki Ikeda, N. Okada, Tomomi Tani, Gohta Goshima, Rudolf Oldenbourg, Akatsuki Kimura

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Institute of General Medical SciencesMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyJapan Society for the Promotion of ScienceNational Institutes of HealthNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology
Mots-clésCytoplasmOrganelleNucleusMicrotubuleCaenorhabditis elegansCentrosomeBiophysicsCell biologyCentrifugeBiologyCellPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Organelles in cells are appropriately positioned, despite crowding in the cytoplasm. However, our understanding of the force required to move large organelles, such as the nucleus, inside the cytoplasm is limited, in part owing to a lack of accurate methods for measurement. We devised a method to apply forces to the nucleus of living Caenorhabditis elegans embryos to measure the force generated inside the cell. We used a centrifuge polarizing microscope to apply centrifugal force and orientation-independent differential interference contrast microscopy to characterize the mass density of the nucleus and cytoplasm. The cellular forces moving the nucleus toward the cell center increased linearly at ~12 pN/μm depending on the distance from the center. The frictional coefficient was ~980 pN s/μm. The measured values were smaller than the previously reported estimates for sea urchin embryos. The forces were consistent with the centrosome-organelle mutual pulling model for nuclear centration. The frictional coefficient was reduced when microtubules were shorter or detached from nuclei in mutant embryos, demonstrating the contribution of astral microtubules. Finally, the frictional coefficient was higher than a theoretical estimate, indicating the contribution of uncharacterized properties of the cytoplasm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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