T6. ASSOCIATIONS OF NUCLEAR-ENCODED MITOCHONDRIAL GENE VARIANTS WITH PSYCHIATRIC DISORDERS
Notice bibliographique
Résumé
Background In cellular bioenergetics , mitochondria play a central role, serving as the primary site for ATP synthesis and have central role on neuronal network dynamics, thereby governing vital neuronal processes and underpinning bioenergetics . Recent molecular studies have demonstrated that mitochondrial dysfunction in the pathophysiology of multiple psychiatric disorders such as bipolar disorder (BD), schizophrenia (SCZ), and major depressive disorder (MDD). We investigated the association of variants in the nuclear-encoded mitochondrial genes (NEMG) with the risks of BD, SCZ, and MDD, and modeled mitochondrial polygenic risk scores (mitoPRS). Methods We performed a random-effects meta-analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) of NEMG based on MitoCarta v3.0 on SCZ Psychiatric Genomics Consortium wave 3 (PGCw3; 27835 SCZ, 35273 controls), BD-PGCw3 (25047 BD, 40740 controls) and MDD-PGCw2 (18494 MDD, 21864 controls) to characterize nuclear-encoded mitochondrial SNP association with each disorder. Furthermore, we performed a mega-analysis using 70% of the datasets to generate mitoPRS for nuclear-mitochondrial encoding SNVs via PRSice-2 and characterized phenotypic variance explained by mitochondrial genes in the held-out test set. Results The meta-analyses of BD and SCZ demonstrated positive associations of NEMG with deviation of the P values from the theoretical distribution, but not in MDD. The mitoPRS for BD and SCZ were strongly associated with each disorder in the held-out cohort (Nagelkerke's pseudo-R2 BD-mitoPRS = 0.032, Nagelkerke's pseudo-R2 SCZ-mitoPRS = 0.034). Discussion The results suggest the evidence for the involvement of nuclear-encoded mitochondrial genetics in susceptibility of BD and SCZ. In the next steps, we aim to generate a next-generation mitoPRS using deep convolutional neural network , and to investigate the association of mitoPRS with clinical characteristics and metabolism in patients with BD and SCZ.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,007 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,015 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».